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Enregistrement W4220654614 · doi:10.1117/12.2613039

Stroke lesion localization in 3D MRI datasets with deep reinforcement learning

2022· article· en· W4220654614 sur OpenAlexaff
Samuel Robertson, Anup Tuladhar, Deepthi Rajashekar, Nils D. Forkert

Notice bibliographique

RevueMedical Imaging 2022: Computer-Aided Diagnosis · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueAdvanced Neural Network Applications
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceArtificial intelligenceReinforcement learningFluid-attenuated inversion recoveryDeep learningTest setStroke (engine)Context (archaeology)Machine learningPattern recognition (psychology)Magnetic resonance imagingRadiologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The efficacy of stroke treatments is highly time-sensitive, and any computer-aided diagnosis support method that can accelerate diagnosis and treatment initiation may improve patient outcomes. Within this context, lesion identification in MRI datasets can be time consuming and challenging, even for trained clinicians. Automatic lesion localization can expedite diagnosis by flagging datasets and corresponding regions of interest for further assessment. In this work, we propose a deep reinforcement learning agent to localize acute ischemic stroke lesions in MRI images. Therefore, we adapt novel techniques from the computer vision domain to medical image analysis, allowing the agent to sequentially localize multiple lesions in a single dataset. The proposed method was developed and evaluated using a database consisting of fluid attenuated inversion recovery (FLAIR) MRI datasets from 466 ischemic stroke patients acquired at multiple centers. 372 patients were used for training while 94 patients (20% of available data) were employed for testing. Furthermore, the model was tested using 58 datasets from an out-of-distribution test set to investigate the generalization error in more detail. The model achieved a Dice score of 0.45 on the hold-out test set and 0.43 on images from the out-of-distribution test set. In conclusion, we apply deep reinforcement learning to the clinically well-motivated task of localizing multiple ischemic stroke lesions in MRI images, and achieve promising results validated on a large and heterogeneous collection of datasets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,887
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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