← Retour à la cohorte
Polygenic prediction of educational attainment within and between families from genome-wide association analyses in 3 million individuals
Aysu Okbay, Yeda Wu, Nancy Wang, Hariharan Jayashankar, Michael Bennett, Seyed Moeen Nehzati, Julia Sidorenko, Hyeokmoon Kweon, Grant Goldman, Tamara Gjorgjieva, Yunxuan Jiang, Barry Hicks, Chao Tian, David A. Hinds, Rafael Ahlskog, Patrik K. E. Magnusson, Sven Oskarsson, Caroline Hayward, Archie Campbell, David J. Porteous, Jeremy Freese, Pamela Herd, Michelle Agee, Babak Alipanahi, Adam Auton, Robert K. Bell, Katarzyna Bryc, Sarah L. Elson, Pierre Fontanillas, Nicholas A. Furlotte, Karen E. Huber, Aaron Kleinman, Nadia K. Litterman, Jennifer C. McCreight, Matthew H. McIntyre, Joanna L. Mountain, Carrie A. M. Northover, Steven J. Pitts, J. Fah Sathirapongsasuti, Olga V. Sazonova, Janie F. Shelton, Suyash Shringarpure, Joyce Y. Tung, Vladimir Vacic, Catherine H. Wilson, Mark Alan Fontana, Tune H. Pers, Cornelius A. Rietveld, Guo‐Bo Chen, Valur Emilsson, S. Fleur W. Meddens, Joseph K. Pickrell, Kevin Thom, Pascal Timshel, Ronald de Vlaming, Abdel Abdellaoui, Tarunveer S. Ahluwalia, Jonas Bačelis, Clemens Baumbach, Gyða Björnsdóttir, J Brandsma, Maria Pina Concas, Jaime Derringer, Tessel E. Galesloot, Giorgia Girotto, Richa Gupta, Leanne M. Hall, Sarah E. Harris, Edith Hofer, Momoko Horikoshi, Jennifer E. Huffman, Kadri Kaasik, Ioanna Panagiota Kalafati, Robert Karlsson, Jari Lahti, Sven J. van der Lee, Christiaan de Leeuw, Penelope A. Lind, Karl‐Oskar Lindgren, Tian Liu, Massimo Mangino, Jonathan Marten, Evelin Mihailov, Michael Miller, Peter J. van der Most, Christopher Oldmeadow, Antony Payton, Natalia Pervjakova, Wouter J. Peyrot, Yong Qian, Olli T. Raitakari, Rico Rueedi, Erika Salvi, Börge Schmidt, Katharina E. Schraut, Jianxin Shi, Albert V. Smith, Raymond A. Poot, Beaté St Pourcain, Alexander Teumer, Guðmar Þorleifsson, Niek Verweij, Dragana Vuckovic, Juergen Wellmann, Harm-Jan Westra, Jingyun Yang, Wei Zhao, Zhihong Zhu, Behrooz Z. Alizadeh, Najaf Amin, Andrew Bakshi, Sebastian E. Baumeister, Ginevra Biino, Klaus Bønnelykke, Patricia A. Boyle, Harry Campbell, Francesco P. Cappuccio, Gail Davies, Jan-Emmanuel De Neve, Panos Deloukas, Ilja Demuth, Jun Ding, Peter Eibich, Lewin Eisele, Niina Eklund, David M. Evans, Jessica D. Faul, Mary F. Feitosa, Andreas J. Forstner, Ilaria Gandin, Bjarni Gunnarsson, Bjarni V. Halldórsson, Tamara B. Harris, Andrew C. Heath, Lynne J. Hocking, Georg Homuth, Michael A. Horan, Jouke‐Jan Hottenga, Philip L. De Jager, Peter K. Joshi, Astanand Jugessur, Marika Kaakinen, Mika Kähönen, Stavroula Kanoni, Liisa Keltigangas-Järvinen, Lambertus A. Kiemeney, Ivana Kolčić, Seppo Koskinen, Aldi T. Kraja, Martin Kroh, Zoltán Kutalik, Antti Latvala, Lenore J. Launer, Maël P. Lebreton, Douglas F. Levinson, Paul Lichtenstein, Peter Lichtner, David C. Liewald, Anu Loukola, Pamela A. F. Madden, Reedik Mägi, Tomi Mäki‐Opas, Riccardo E. Marioni, Pedro Marques‐Vidal, Gerardus A. Meddens, George McMahon, Christa Meisinger, Thomas Meitinger, Yusplitri Milaneschi, Lili Milani, Grant W. Montgomery, Ronny Myhre, Christopher P. Nelson, Dale R. Nyholt, William Ollier, Aarno Palotie, Lavinia Paternoster, Nancy L. Pedersen, Katja Petrovic, Katri Räikkönen, Susan M. Ring, Antonietta Robino, Olga Rostapshova, Igor Rudan, Aldo Rustichini, Veikko Salomaa, Alan R. Sanders, Antti‐Pekka Sarin, Helena Schmidt, Rodney J. Scott, Blair H. Smith, Jennifer A. Smith, Jan A. Staessen, Elisabeth Steinhagen–Thiessen, Konstantin Strauch, Antonio Terracciano, Martin D. Tobin, Sheila Ulivi, Simona Vaccargiu, Lydia Quaye, Frank J.A. van Rooij, Cristina Venturini, Anna A. E. Vinkhuyzen, Uwe Völker, Henry Völzke, Judith M. Vonk, Diego Vozzi, Johannes Waage, Erin B. Ware, Gonneke Willemsen, John Attia, David A. Bennett, Lars Bertram, Hans Bisgaard, Dorret I. Boomsma, Ingrid B. Borecki, Ute Bültmann, Christopher F. Chabris, Francesco Cucca, Daniele Cusi, Ian J. Deary, George Dedoussis, Cornelia M. van Duijn, Johan G. Eriksson, Barbara Franke, Lude Franke, Paolo Gasparini, Pablo V. Gejman, Christian Gieger, Hans J. Grabe, Jacob Gratten, Patrick J. F. Groenen, Vilmundur Guðnason, Pim van der Harst, Wolfgang Hoffmann, Elina Hyppönen, William G. Iacono, Bo Jacobsson, Marjo‐Riitta Järvelin, Karl‐Heinz Jöckel, Jaakko Kaprio, Sharon L. R. Kardia, Terho Lehtimäki, Steven F. Lehrer, Nicholas G. Martin, Matt McGue, Andres Metspalu, Neil Pendleton, Brenda W.J.H. Penninx, Markus Perola, Nicola Pirastu, Mario Pirastu, Ozren Polašek, Daniëlle Posthuma, Christopher Power, Michael A. Province, Nilesh J. Samani, David Schlessinger, Reinhold Schmidt, Thorkild I. A. Sørensen, Tim D. Spector, Kāri Stefánsson, Unnur Þorsteinsdóttir, Roy Thurik, Nicholas J. Timpson, Henning Tiemeier, André G. Uitterlinden, Véronique Vitart, Péter Vollenweider, David R. Weir, James F. Wilson, Alan F. Wright, Dalton Conley, Robert F. Krueger, George Davey Smith, Albert Hofman, David Laibson, Sarah E. Medland, Jian Yang, Tõnu Esko, Chelsea Watson, Jonathan Jala, Philipp Koellinger, Magnus Johannesson, Michelle N. Meyer, James J. Lee, Augustine Kong, Loïc Yengo, David Cesarini, Patrick Turley, Peter M. Visscher, Jonathan Beauchamp, Daniel J. Benjamin, Alexander I. Young
Notice bibliographique
RevueNature Genetics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensQueen's UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilAustralian Research CouncilMedical Research CouncilNational Institute of Mental HealthSocial Sciences and Humanities Research Council of CanadaOulun YliopistoDepartment of Education and TrainingRiksbankens JubileumsfondVetenskapsrådetGenome CanadaLundbeckfondenErasmus Universiteit RotterdamUniversity of South AustraliaUniversity of QueenslandNational Institutes of HealthOpen Philanthropy ProjectNetherlands Heart InstituteImperial College LondonOntario Genomics InstituteNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekLi Ka Shing FoundationSteno Diabetes Center CopenhagenNational Institute on AgingPershing Square FoundationEconomic and Social Research CouncilU.S. Department of Health and Human ServicesSchool of Public Health, Imperial College LondonOntario GenomicsRagnar Söderbergs stiftelseGovernment of Canada
Mots-clésGenome-wide association studyBiologySingle-nucleotide polymorphismGeneticsGenetic associationGenomeMultifactorial InheritanceGenotypeGene
Résumé
We conduct a genome-wide association study (GWAS) of educational attainment (EA) in a sample of ~3 million individuals and identify 3,952 approximately uncorrelated genome-wide-significant single-nucleotide polymorphisms (SNPs). A genome-wide polygenic predictor, or polygenic index (PGI), explains 12-16% of EA variance and contributes to risk prediction for ten diseases. Direct effects (i.e., controlling for parental PGIs) explain roughly half the PGI's magnitude of association with EA and other phenotypes. The correlation between mate-pair PGIs is far too large to be consistent with phenotypic assortment alone, implying additional assortment on PGI-associated factors. In an additional GWAS of dominance deviations from the additive model, we identify no genome-wide-significant SNPs, and a separate X-chromosome additive GWAS identifies 57.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,526
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations689
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui