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Enregistrement W4220768918 · doi:10.1101/2022.03.30.486377

ACE2 engagement exposes the fusion peptide to pan-coronavirus neutralizing antibodies

2022· preprint· en· W4220768918 sur OpenAlexfundno aff
Jun Siong Low, Josipa Jerak, M. Alejandra Tortorici, Matthew McCallum, Dora Pinto, Antonino Cassotta, Mathilde Foglierini, Federico Mele, Rana Abdelnabi, Birgit Weynand, Julia Noack, Martin Montiel-Ruiz, Siro Bianchi, Fabio Benigni, Nicole Sprugasci, Anshu Joshi, John E. Bowen, Alexandra C. Walls, David Jarrossay, Diego Morone, Philipp Paparoditis, Christian Garzoni, Paolo Ferrari, Alessandro Ceschi, Johan Neyts, Lisa A. Purcell, Gyorgy Snell, Davide Corti, Antonio Lanzavecchia, David Veesler, Federica Sallusto

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHelmut Horten StiftungEidgenössische Technische Hochschule ZürichUniversity of WashingtonFast GrantsInstitute for Research in BiomedicineBurroughs Wellcome FundHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésMonoclonal antibodyVirologyEpitopeGlycoproteinCoronavirusBiologyAntibodyLipid bilayer fusionPeptideNeutralizing antibodyViral entryFusion proteinMolecular biologyVirusCoronavirus disease 2019 (COVID-19)GeneGeneticsBiochemistryRecombinant DNAMedicineViral replicationInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Coronaviruses use diverse Spike (S) glycoproteins to attach to host receptors and fuse with target cells. Using a broad screening approach, we isolated from SARS-CoV-2 immune donors seven monoclonal antibodies (mAbs) that bind to all human alpha and beta coronavirus S proteins. These mAbs recognize the fusion peptide and acquire high affinity and breadth through somatic mutations. Despite targeting a conserved motif, only some mAbs show broad neutralizing activity in vitro against alpha and beta coronaviruses, including Omicron BA.1 variant and bat WIV-1, and reduce viral titers and pathology in vivo. Structural and functional analyses show that the fusion peptide-specific mAbs bind with different modalities to a cryptic epitope which is concealed by prefusion-stabilizing ‘2P’ mutations and becomes exposed upon binding of ACE2 or ACE2-mimicking mAbs. This study identifies a new class of pan-coronavirus neutralizing mAbs and reveals a receptor-induced conformational change in the S protein that exposes the fusion peptide region.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,333
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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