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Enregistrement W4220796889 · doi:10.1101/2022.03.21.22272043

DNAmFitAge: Biological Age Indicator Incorporating Physical Fitness

2022· preprint· en· W4220796889 sur OpenAlexaff
Kristen M. McGreevy, Zsolt Radák, Ferenc Torma, Ake T Lu, Daniel W. Belsky, Alexandra M. Binder, Luigi Ferrucci, Riccardo E. Marioni, Simon R. Cox, Michael Kober, David L. Corcoran, Steve Horvath

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research Council
Mots-clésdNaMEpigeneticsPhysical fitnessGrip strengthBiological ageGerontologyDNA methylationMedicineBioinformaticsBiologyPhysical therapyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Physical fitness is a well-known correlate of health and the aging process. DNA methylation (DNAm) data lend themselves for estimating chronological and biological age through epigenetic clocks. However, current epigenetic clocks did not yet use measures of mobility, strength, lung, or endurance physical fitness parameters in their construction. Here, we develop blood DNAm biomarkers for fitness parameters gait speed (walking speed), hand grip strength, forced expiratory volume in one second (FEV1), and maximal oxygen uptake (VO2max). We then use these DNAm biomarkers to construct DNAmFitAge, a new biological age indicator that incorporates physical fitness with epigenetic mortality risk estimators. Adjusting DNAmFitAge for chronological age generates a novel measure of epigenetic age acceleration, FitAgeAcceleration, which is informative for physical activity level (p=1.2E-12), mortality risk (p=5.9E-13), coronary heart disease risk (p=0.0051), comorbidities (p=9.0E-9), and disease-free status (p=1.1E-6) across several large validation datasets. These newly constructed DNAm biomarkers and DNAmFitAge provide researchers and physicians a new method to incorporate physical fitness into epigenetic clocks and emphasizes the effect of lifestyle on the aging process.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,217
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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