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Enregistrement W4220800921 · doi:10.1186/s12911-021-01738-w

Bayesian updating and sequential testing: overcoming inferential limitations of screening tests

2022· article· en· W4220800921 sur OpenAlexaff
Jacques Balayla

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Informatics and Decision Making · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlgorithmPredictive valueBayes' theoremArtificial intelligenceMathematicsMachine learningNaive Bayes classifierComputer scienceBayesian probabilityStatisticsMedicineInternal medicineSupport vector machine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Bayes' theorem confers inherent limitations on the accuracy of screening tests as a function of disease prevalence. Herein, we establish a mathematical model to determine whether sequential testing with a single test overcomes the aforementioned Bayesian limitations and thus improves the reliability of screening tests. METHODS: We use Bayes' theorem to derive the positive predictive value equation, and apply the Bayesian updating method to obtain the equation for the positive predictive value (PPV) following repeated testing. We likewise derive the equation which determines the number of iterations of a positive test needed to obtain a desired positive predictive value, represented graphically by the tablecloth function. RESULTS: For a given PPV ([Formula: see text]) approaching k, the number of positive test iterations needed given a prevalence of disease ([Formula: see text]) is: [Formula: see text] where [Formula: see text] = number of testing iterations necessary to achieve [Formula: see text], the desired positive predictive value, ln = the natural logarithm, a = sensitivity, b = specificity, [Formula: see text] = disease prevalence/pre-test probability and k = constant. CONCLUSIONS: Based on the aforementioned derivation, we provide reference tables for the number of test iterations needed to obtain a [Formula: see text] of 50, 75, 95 and 99% as a function of various levels of sensitivity, specificity and disease prevalence/pre-test probability. Clinical validation of these concepts needs to be obtained prior to its widespread application.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,082
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,320
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,918
Score d'incertitude au seuil0,433

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0820,320
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,005
Communication savante0,0040,006
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0030,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,140
Tête enseignante GPT0,361
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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