Acids produced by lactobacilli inhibit the growth of commensal <i>Lachnospiraceae</i> and S24-7 bacteria
Notice bibliographique
Résumé
The Lactobacillaceae are an intensively studied family of bacteria widely used in fermented food and probiotics, and many are native to the gut and vaginal microbiota of humans and other animals. Various studies have shown that specific Lactobacillaceae species produce metabolites that can inhibit the colonization of fungal and bacterial pathogens, but less is known about how Lactobacillaceae affect individual bacterial species in the endogenous animal microbiota. Here, we show that numerous Lactobacillaceae species inhibit the growth of the Lachnospiraceae family and the S24-7 group, two dominant clades of bacteria within the gut. We demonstrate that inhibitory activity is a property common to homofermentative Lactobacillaceae species, but not to species that use heterofermentative metabolism. We observe that homofermentative Lactobacillaceae species robustly acidify their environment, and that acidification alone is sufficient to inhibit growth of Lachnospiraceae and S24-7 growth, but not related species from the Clostridiales or Bacteroidales orders. This study represents one of the first in-depth explorations of the dynamic between Lactobacillaceae species and commensal intestinal bacteria, and contributes valuable insight toward deconvoluting their interactions within the gut microbial ecosystem.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».