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Enregistrement W4220838295 · doi:10.3201/eid2805.220318

Intercontinental Movement of Highly Pathogenic Avian Influenza A(H5N1) Clade 2.3.4.4 Virus to the United States, 2021

2022· article· en· W4220838295 sur OpenAlexfundno aff
Sarah N. Bevins, Susan A. Shriner, James C. Cumbee, Krista E. Dilione, Kelly E. Douglass, Jeremy W. Ellis, Mary Lea Killian, Mia Kim Torchetti, Julianna B. Lenoch

Notice bibliographique

RevueEmerging infectious diseases · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Fish and Wildlife ServiceCanadian Food Inspection AgencyU.S. Department of Agriculture
Mots-clésFlywayWaterfowlInfluenza A virus subtype H5N1CladeHighly pathogenicAvian influenza virusInfluenza A virusLineage (genetic)VirologyBiologyVirusZoologyGeographyPhylogeneticsEcologyGeneGeneticsHabitat

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Study Wild bird samples are routinely collected by the US Department of Agriculture, Animal Plant Health Inspection Service, Wildlife Services, National Wildlife Disease Program (National Wildlife Disease Program, US Fish and Wildlife Service permit no.MB124992 0) and screened for AIV in conjunction with the National Animal Health Laboratory Network and with the National Veterinary Services Laboratories (Ames, Iowa, USA) as part of a targeted AIV surveillance program in wild birds (6).Samples analyzed in this investigation came from routine wild bird surveillance activities in the US Atlantic Flyway and were primarily obtained from hunter harvest activities, live-trapping, and bird banding operations.These surveillance data, combined with bird band-recovery movement data, can shed light on AIV occurrence on the landscape, and findings in wild birds can act as an early warning system for spillover risk to poultry and humans (6).For these analyses, we initially screened wild bird samples by using an influenza matrix gene real-time, reverse transcription PCR.We then tested matrix gene presumptive positive samples by using H5 and H7 subtype-specific, real-time reverse transcription PCRs.Influenza A virus RNA from wild bird samples Intercontinental Movement of Highly Pathogenic Avian Influenza A(H5N1) Clade 2.3.4.4 Virus to the United States, 2021

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,060

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,324
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations218
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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