snz/SNX25 at the crossroad of endocytosis and lipid handling in autophagy
Notice bibliographique
Résumé
Macroautophagy/autophagy is coupled to a myriad of intracellular processes, among which vesicular trafficking is an important contributor of membranes and proteins required at various stages, from autophagosome formation to degradation. Hence, understanding how membrane trafficking is coupled to autophagy induction and how cells rewire trafficking upon high autophagic needs is instrumental to our understanding of autophagy. In our recent manuscript, we tested a known class of endosomal sorting regulators, the sorting nexin family, for their involvement in autophagy in Drosophila. We identified snz (snazarus) as an important regulator of autophagy in Drosophila as well as in mammalian cells, by demonstrating a role for the snz human ortholog SNX25 in HeLa cells. Using knockout rescue experiments, we observed that SNX25 loss affects many cellular processes, namely VAMP8 endocytosis and lipid handling. Mutational studies identified separate protein domains involved in these processes. Given the role of this sorting nexin family in lipid droplet regulation, our work expands their requirement to autophagy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».