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Enregistrement W4220864774 · doi:10.1016/j.sbi.2022.102349

Structural bases of T cell antigen receptor recognition in celiac disease

2022· review· en· W4220864774 sur OpenAlexaff
Laura Ciacchi, Hugh H. Reid, Jamie Rossjohn

Notice bibliographique

RevueCurrent Opinion in Structural Biology · 2022
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCeliac Disease Research and Management
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpitopeDeamidationT-cell receptorHuman leukocyte antigenImmunologyGlutenT cellAntigenBiologyImmune systemBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Celiac disease (CeD) is a human leukocyte antigen (HLA)-linked autoimmune-like disorder that is triggered by the ingestion of gluten or related storage proteins. The majority of CeD patients are HLA-DQ2.5+, with the remainder being either HLA-DQ8+ or HLA-DQ2.2+. Structural studies have shown how deamidation of gluten epitopes engenders binding to HLA-DQ2.5/8, which then triggers an aberrant CD4+ T cell response. HLA tetramer studies, combined with structural investigations, have demonstrated that repeated patterns of TCR usage underpins the immune response to some HLADQ2.5/8 restricted gluten epitopes, with distinct TCR motifs representing common landing pads atop the HLA–gluten complexes. Structural studies have provided insight into TCR specificity and cross-reactivity towards gluten epitopes, as well as cross-reactivity to bacterial homologues of gluten epitopes, suggesting that environmental factors may directly play a role in CeD pathogenesis. Collectively, structural immunology-based studies in the CeD axis may lead to new therapeutics/diagnostics to treat CeD, and also serve as an exemplar for other T cell mediated autoimmune diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,989
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,173
Tête enseignante GPT0,441
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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