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Enregistrement W4220878792 · doi:10.1111/pbi.13818

<i>Brassica napus</i> genes <i>Rlm4</i> and <i>Rlm7</i> , conferring resistance to <i>Leptosphaeria maculans</i> , are alleles of the <i>Rlm9</i> wall‐associated kinase‐like resistance locus

2022· article· en· W4220878792 sur OpenAlexafffundabout
Parham Haddadi, Nicholas J. Larkan, Angela Van deWouw, Yueqi Zhang, Ting Xiang Neik, Elena Beynon, Philipp E. Bayer, David Edwards, Jacqueline Batley, M. Hossein Borhan

Notice bibliographique

RevuePlant Biotechnology Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaGrains Research and Development CorporationCanola Council of CanadaSaskatchewan Canola Development Commission
Mots-clésLeptosphaeria maculansBiologyLocus (genetics)AlleleGeneGeneticsBrassicaR geneSclerotinia sclerotiorumResistance (ecology)Plant disease resistanceBotanyAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plant cell surface receptors are at the forefront of defence against pathogens, involved in pathogen sensing through the detection of conserved molecules named pathogen-associated molecular patterns (PAMP) and highly variable pathogen virulence (effector) proteins. The recently reported Brassica napus (canola, oilseed rape) disease resistance gene Rlm9 encodes a wall-associated kinase-like (WAKL) receptor which confers race-specific resistance against races of the blackleg pathogen Leptosphaeria maculans carrying the corresponding effector gene, AvrLm5-9 (Larkan et al., 2020). Rlm4 and Rlm7 are located on B. napus chromosome A07 and genetically tightly linked to Rlm9 (Larkan et al., 2016). The L. maculans effectors AvrLm4-7 and AvrLm7 are small, secreted cysteine-rich proteins encoded by a single locus, AvrLm4-7. A single amino acid change in AvrLm4-7 masks recognition by Rlm4 without affecting Rlm7 function. Here, we report the cloning of Rlm4 and Rlm7, both alleles of the Rlm9 WAKL locus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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