Cathepsin D as biomarker in cerebrospinal fluid of nusinersen‐treated patients with spinal muscular atrophy
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND PURPOSE: The therapeutic landscape of spinal muscular atrophy (SMA) has changed dramatically during the past 4 years, but treatment responses differ remarkably between individuals, and therapeutic decision-making remains challenging, underlining the persistent need for validated biomarkers. METHODS: We applied untargeted proteomic analyses to determine biomarkers in cerebrospinal fluid (CSF) samples of SMA patients under treatment with nusinersen. Identified candidate proteins were validated in CSF samples of SMA patients by Western blot and enzyme-linked immunosorbent assay. Furthermore, levels of peripheral neurofilament heavy and light chain were determined. RESULTS: Untargeted proteomic analysis of CSF samples of three SMA type 1 patients revealed the lysosomal protease cathepsin D as a candidate biomarker. Subsequent validation analysis in a larger cohort of 31 pediatric SMA patients (type 1, n = 12; type 2, n = 9; type 3, n = 6; presymptomatically treated, n = 4; age = 0-16 years) revealed a significant decline of cathepsin D levels in SMA patients aged ≥2 months at the start of treatment. Although evident in all older age categories, this decline was only significant in the group of patients who showed a positive motor response. Moreover, downregulation of cathepsin D was evident in muscle biopsies of SMA patients. CONCLUSIONS: We identified a decline of cathepsin D levels in CSF samples of SMA patients under nusinersen treatment that was more pronounced in the group of "treatment responders" than in "nonresponders." We believe that our results indicate a suitability of cathepsin D levels as a possible biomarker in SMA also in older patients, in combination with analysis of peripheral neurofilament light chain in adolescents or alone in adult patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».