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Enregistrement W4220909641 · doi:10.1111/ene.15331

Cathepsin D as biomarker in cerebrospinal fluid of nusinersen‐treated patients with spinal muscular atrophy

2022· article· en· W4220909641 sur OpenAlexafffund
David Schorling, Heike Kölbel, Andreas Hentschel, Astrid Pechmann, Nancy Meyer, Brunhilde Wirth, Roman Rombo, Albert Sickmann, Janbernd Kirschner, Ulrike Schara‐Schmidt, Hanns Lochmüller, Andreas Roos

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Neurology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlbert-Ludwigs-Universität FreiburgBundesministerium für Bildung und ForschungH2020 European Research CouncilCanada Research ChairsDeutsche ForschungsgemeinschaftMuscular Dystrophy CanadaCanada Foundation for InnovationMinisterium für Kultur und Wissenschaft des Landes Nordrhein-WestfalenFrench Muscular Dystrophy Association
Mots-clésSMA*Spinal muscular atrophyBiomarkerCerebrospinal fluidMedicineCathepsinCathepsin DCohortInternal medicineAtrophyGastroenterologyWestern blotPathologyOncologyBiologyBiochemistryEnzymeDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND PURPOSE: The therapeutic landscape of spinal muscular atrophy (SMA) has changed dramatically during the past 4 years, but treatment responses differ remarkably between individuals, and therapeutic decision-making remains challenging, underlining the persistent need for validated biomarkers. METHODS: We applied untargeted proteomic analyses to determine biomarkers in cerebrospinal fluid (CSF) samples of SMA patients under treatment with nusinersen. Identified candidate proteins were validated in CSF samples of SMA patients by Western blot and enzyme-linked immunosorbent assay. Furthermore, levels of peripheral neurofilament heavy and light chain were determined. RESULTS: Untargeted proteomic analysis of CSF samples of three SMA type 1 patients revealed the lysosomal protease cathepsin D as a candidate biomarker. Subsequent validation analysis in a larger cohort of 31 pediatric SMA patients (type 1, n = 12; type 2, n = 9; type 3, n = 6; presymptomatically treated, n = 4; age = 0-16 years) revealed a significant decline of cathepsin D levels in SMA patients aged ≥2 months at the start of treatment. Although evident in all older age categories, this decline was only significant in the group of patients who showed a positive motor response. Moreover, downregulation of cathepsin D was evident in muscle biopsies of SMA patients. CONCLUSIONS: We identified a decline of cathepsin D levels in CSF samples of SMA patients under nusinersen treatment that was more pronounced in the group of "treatment responders" than in "nonresponders." We believe that our results indicate a suitability of cathepsin D levels as a possible biomarker in SMA also in older patients, in combination with analysis of peripheral neurofilament light chain in adolescents or alone in adult patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,142
Score d'incertitude au seuil0,525

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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