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Enregistrement W4220920732 · doi:10.1139/cjb-2021-0113

Chromosome number, heterochromatin, and genome size support recent polyploid origin of the <i>Epidendrum nocturnum</i> group and reveal a new species (Laeliinae, Orchidaceae)

2022· article· en· W4220920732 sur OpenAlexvenueno aff
Joel Maciel Pereira Cordeiro, Mark W. Chase, Eric Hágsater, Erton Mendonça de Almeida, Lucas Costa, Gustavo A. de Souza, Felipe Nollet, Leonardo P. Félix

Notice bibliographique

RevueBotany · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPolyploidPloidyGenome sizeHeterochromatinOrchidaceaeGenomeChromosomeBotanyEvolutionary biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Epidendrum nocturnum Jacq. group comprises about 60 species. Nine species occur in Brazil, predominantly in the Atlantic and Amazon Forests. The group is taxonomically complex because its species are morphologically similar and not easily distinguished. The main objective of this work is to characterize their chromosome evolution and how this has affected species delimitation in Brazilian representatives of the E. nocturnum group. We used chromosome numbers, heterochromatin band patterns, and genome size variation to better understand the chromosome variation, species delimitation, and the relationship among seven representatives of this group. A new species from the Cerrado/Amazon Rainforest ecotone is described based on cytological and morphological characters. The new species, Epidendrum pareciense sp. nov., is a diploid (2n = 40), Epidendrum bahiense Rchb.f., Epidendrum carpophorum Barb.Rodr., Epidendrum micronocturnum Carnevali &amp; G.A.Romero, Epidendrum purpureocaulis Sambin &amp; Essers, and E. nocturnum are tetraploids (2n = 80), and Epidendrum tumuc-humaciense (Veyret) Carnevali &amp; G.A.Romero is hexaploid (2n = 120), the last a new ploidy for the group. Heterochromatin in these species is characterized by guanine-cytosine-rich regions (cromomycin A3 (CMA + ) bands) on proximal and terminal regions associated with NORs. Genome size and numbers of CMA terminal bands are directly related to ploidy, suggesting that diploidization has not yet occurred and supporting the hypothesis of a recent polyploid origin for the E. nocturnum group.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,921
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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