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Enregistrement W4220930590 · doi:10.1101/2022.03.05.483010

Meta-analysis and experimental re-evaluation of the Boyle van ‘t Hoff relation with osmoregulation modelled by linear elastic principles and ion-osmolyte leakage

2022· preprint· en· W4220930590 sur OpenAlexaff
Dominic Olver, Iqra Azam, James D. Benson

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueErythrocyte Function and Pathophysiology
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOsmolyteTurgor pressureChemistryOsmotic pressureBiological systemBiophysicsMathematicsMaterials scienceBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT In this study we challenge the paradigm of using the Boyle van ’t Hoff (BvH) relation to relate cell size as a linear function of inverse extracellular osmotic pressure for short time periods (~5 to 30 mins). We present alternative models that account for mechanical resistance (turgor model) and ion-osmolyte leakage (leak model), which is not accounted for by the BvH relation. To test the BvH relation and the alternative models, we conducted a meta-analysis of published BvH datasets, as well as new experiments using a HepG2 cell line. Our meta-analysis showed that the BvH relation may be assumed of the hypertonic region but cannot be assumed a priori over the hyper- and hypotonic region. Both alternative models perform better than the BvH relation but are nearly indistinguishable when plotted. The return to isotonic conditions plot indicated neither alternative model accurate predicts return volumes for HepG2 cells. However, a combined turgor-leak model accurately predicts both the BvH plot and the return to isotonic conditions plot. Moreover, this turgor-leak model provides a facile method to estimate the membrane-cortex Young’s modulus and the cell membrane permeability to intracellular ions/osmolytes during periods of osmotic challenge, and predicts a novel passive method of volume regulation without the need for ion pumps.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,675
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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