Mucin foraging enables Akkermansia muciniphila to compete against other microbes in the gut and to modulate host sterol biosynthesis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Akkermansia muciniphila, a prominent member of the gastrointestinal tract (GI) microbiota, uses mucins as a sole source of carbon and nitrogen. A. muciniphila is considered a next-generation probiotic because its abundance in humans positively correlates with protection from metabolic syndrome and obesity. However, A. muciniphila is intractable to genetic analysis and thus the molecular mechanisms underlying the metabolism of mucin, its colonization of the GI tract, and its impact on host physiology are poorly understood. Here, we developed and applied transposon mutagenesis to identify A. muciniphila factors important for the use of mucin and determined that mucin degradation products accumulate in internal compartments through a process that requires pili and a periplasmic protein complex. We further determined that the degradation of mucin and related proteoglycans is important for colonization of the GI by A. muciniphila but only in the context of competing microbes. In germ free mice, mucin use by A. muciniphila repressed the expression of host genes required for mevalonate and cholesterol biosynthesis in the colon, providing a molecular link between A. muciniphila metabolism of mucins, the regulation of lipid homeostasis and potential probiotic activities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».