Role of cellular retinol‐binding protein, type 1 and retinoid homeostasis in the adult mouse heart: A multi‐omic approach
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The main active metabolite of Vitamin A, all ‐ trans retinoic acid (RA), is required for proper cellular function and tissue organization. Heart development has a well‐defined requirement for RA, but there is limited research on the role of RA in the adult heart. Homeostasis of RA includes regulation of membrane receptors, chaperones, enzymes, and nuclear receptors. Cellular retinol‐binding protein, type 1 (CRBP1), encoded by retinol‐binding protein, type 1 ( Rbp1 ), regulates RA homeostasis by delivering vitamin A to enzymes for RA synthesis and protecting it from non‐specific oxidation. In this work, a multi‐omics approach was used to characterize the effect of CRBP1 loss using the Rbp1 −/− mouse. Retinoid homeostasis was disrupted in Rbp1 −/− mouse heart tissue, as seen by a 33% and 24% decrease in RA levels in the left and right ventricles, respectively, compared to wild‐type mice (WT). To further inform on the effect of disrupted RA homeostasis, we conducted high‐throughput targeted metabolomics. A total of 222 metabolite and metabolite combinations were analyzed, with 33 having differential abundance between Rbp1 −/− and WT hearts. Additionally, we performed global proteome profiling to further characterize the impact of CRBP1 loss in adult mouse hearts. More than 2606 unique proteins were identified, with 340 proteins having differential expression between Rbp1 −/− and WT hearts. Pathway analysis performed on metabolomic and proteomic data revealed pathways related to cellular metabolism and cardiac metabolism were the most disrupted in Rbp1 −/− mice. Together, these studies characterize the effect of CRBP1 loss and reduced RA in the adult heart.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».