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Enregistrement W4220951323 · doi:10.1101/2022.03.11.483876

<i>In vitro</i> susceptibility to β-lactam antibiotics and viability of <i>Neisseria gonorrhoeae</i> strains producing plasmid-mediated broad- and extended-spectrum β-lactamases

2022· preprint· en· W4220951323 sur OpenAlexaboutno aff
Ilya Kandinov, Dmitry Gryadunov, Alexandra Vinokurova, О. В. Антонова, А. А. Кубанов, В С Соломка, Julia Shagabieva, D. G. Deryabin, Boris Shaskolskiy

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Health of the Russian FederationMinistry of Science and Higher Education of the Russian FederationRussian Science Foundation
Mots-clésNeisseria gonorrhoeaeMicrobiologyCefotaximePlasmidCephalosporinBiologyAmpicillinMeropenemCephaloridineAntibioticsAntibiotic resistanceDNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT N. gonorrhoeae strains producing plasmid-mediated broad- and extended-spectrum β-lactamases (ESBLs) have been obtained in vitro and studied for their viability and susceptibility to β-lactam antibiotics. The artificial p bla TEM-1 and p bla TEM-20 plasmids were constructed by site-directed mutagenesis from a p bla TEM-135 plasmid of the Toronto/Rio type, which was extracted from the clinical isolate. MIC values were determined for a series of β-lactam antibiotics, including benzylpenicillin, ampicillin, cefuroxime, ceftriaxone, cefixime, cefotaxime, cefepime, meropenem, imipenem, and doripenem. The N. gonorrhoeae strain carrying the p bla TEM-20 plasmid exhibited a high level of resistance to penicillins and II-IV generation cephalosporins (MIC ≥ 2 mg/L) but not to carbapenems (MIC ≤ 0.008 mg/L). However, this strain stopped growing after 6 hours of cultivation. The reduced viability was not associated with the plasmid loss but can be explained by the following factors: the presence of the plasmid itself, which requires additional costs for its reproduction, and the expression of ESBL, which can affect the structure of the peptidoglycan layer in the cell membrane. The cell growth was mathematically modeled using the generalized Verhulst equation. The parameter, characterizing the maximum possible number of cells grown under given conditions, decreased within the wild type (without plasmids) - p bla TEM-135 - p bla TEM-1 - p bla TEM-20 series, i.e. , the plasmid-bearing strains had reduced viability compared to that of the wild-type strain. The kinetics for the cell death of N. gonorrhoeae strains without the p bla TEM-20 plasmid in the presence of ceftriaxone can be described by a modified Chick-Watson law. For the N. gonorrhoeae strain that harbors the p bla TEM-20 plasmid, the kinetics for cell number changes with time reflected several processes: the hydrolysis of ceftriaxone by TEM-20 β-lactamase, growth and gradual death of cells. The demonstrated reduced viability of N. gonorrhoeae strains with the p bla TEM-20 plasmid probably explains the absence of clinical isolates of N. gonorrhoeae that produce ESBL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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