Combinatorial optimization of mRNA structure, stability, and translation for RNA-based therapeutics
Pourquoi ce travail est-il dans la base ?
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.
Scores machine (provisoires)
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
- Écart entre enseignants
- 0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
- Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline· tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle
Résumé
Therapeutic mRNAs and vaccines are being developed for a broad range of human diseases, including COVID-19. However, their optimization is hindered by mRNA instability and inefficient protein expression. Here, we describe design principles that overcome these barriers. We develop an RNA sequencing-based platform called PERSIST-seq to systematically delineate in-cell mRNA stability, ribosome load, as well as in-solution stability of a library of diverse mRNAs. We find that, surprisingly, in-cell stability is a greater driver of protein output than high ribosome load. We further introduce a method called In-line-seq, applied to thousands of diverse RNAs, that reveals sequence and structure-based rules for mitigating hydrolytic degradation. Our findings show that highly structured "superfolder" mRNAs can be designed to improve both stability and expression with further enhancement through pseudouridine nucleoside modification. Together, our study demonstrates simultaneous improvement of mRNA stability and protein expression and provides a computational-experimental platform for the enhancement of mRNA medicines.
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La notice
- Revue
- Nature Communications
- Thématique
- RNA and protein synthesis mechanisms
- Domaine
- Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
- Établissements canadiens
- —
- Organismes subventionnaires
- Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of General Medical SciencesNational Science FoundationDamon Runyon Cancer Research FoundationCanadian Institutes of Health ResearchChemistry, Engineering and Medicine for Human Health, Stanford UniversityStanford Bio-XUniversity of California, San FranciscoBaiduOregon State UniversityPfizerNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
- Mots-clés
- PseudouridineTranslation (biology)Messenger RNARNARibosomeComputational biologyStability (learning theory)Cell biologyBiologyComputer scienceTransfer RNABiochemistryGene
- Résumé présent dans OpenAlex
- oui