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Enregistrement W4221009865 · doi:10.1186/s40168-021-01184-w

Endometrial microbiota composition is associated with reproductive outcome in infertile patients

2022· article· en· W4221009865 sur OpenAlexaff
Inmaculada Moreno, Iolanda Garcia-Grau, David Pérez-Villaroya, Marta Gonzáléz-Monfort, Mustafa Bahçeci, Marcelo J. Barrionuevo, Sagiri Taguchi, Elena Puente, Michael DiMattina, Mei Wei Lim, Georgina Meneghini, Mira Aubuchon, M.P. Leondires, Alexandra Izquierdo, Martina Perez-Olgiati, Alejandro Chávez-Badiola, Ken Seethram, Davide Baù, Carlos Gómez, Diana Valbuena, Felipe Vilella, Carlos Simón

Notice bibliographique

RevueMicrobiome · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensPacific Centre for Reproductive Medicine
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIIHorizon 2020 Framework ProgrammeMinisterio de Asuntos Económicos y Transformación Digital, Gobierno de EspañaMinisterio de Economía y CompetitividadMinisterio de Educación, Cultura y DeporteEuropean CommissionConselleria d'Educació, Investigació, Cultura i EsportMinisterio de Ciencia, Innovación y Universidades
Mots-clésBiologyMiscarriageUreaplasmaPregnancyMicrobiomeGardnerella vaginalisReproductive medicineEmbryo transferGynecologyObstetricsBacterial vaginosisMedicineBioinformaticsMicrobiologyMycoplasmaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Previous evidence indicates associations between the female reproductive tract microbiome composition and reproductive outcome in infertile patients undergoing assisted reproduction. We aimed to determine whether the endometrial microbiota composition is associated with reproductive outcomes of live birth, biochemical pregnancy, clinical miscarriage or no pregnancy. METHODS: Here, we present a multicentre prospective observational study using 16S rRNA gene sequencing to analyse endometrial fluid and biopsy samples before embryo transfer in a cohort of 342 infertile patients asymptomatic for infection undergoing assisted reproductive treatments. RESULTS: A dysbiotic endometrial microbiota profile composed of Atopobium, Bifidobacterium, Chryseobacterium, Gardnerella, Haemophilus, Klebsiella, Neisseria, Staphylococcus and Streptococcus was associated with unsuccessful outcomes. In contrast, Lactobacillus was consistently enriched in patients with live birth outcomes. CONCLUSIONS: Our findings indicate that endometrial microbiota composition before embryo transfer is a useful biomarker to predict reproductive outcome, offering an opportunity to further improve diagnosis and treatment strategies. Video Abstract.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations311
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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