Molecular Detection of Age-Related Abundance and Diversity of Bifidobacterium spp. in Pastured Goats
Notice bibliographique
Résumé
Bifidobacterium spp. are among bacteria being developed as probiotics for farm animals. Understanding diversity of the normal gut inhabitants is a prerequisite to developing species-specific probiotics strains that are likely to establish in the host. For many farm animals including goats, the normal gut Bifidobacterium inhabitants have not been characterized including age based differences. The objective of this exploratory study was to gain preliminary understanding of abundance and diversity of Bifidobacterium species in goats of different ages. Molecular methods have given scientists fast methods for exploratory insights into previously uncharacterized microbiomes. Consequently, in this study we utilized molecular assays using genus and species specific primers to characterize Bifidobacterium in pastured goats. Although Bifidobacterium were detected in all ages, younger animals had higher counts than older goats. In goats below six months of age, B. angulatum, B. dentium, B. gallicum, B. animalis sub animalis, B. longum and B. catenulatum were detected. In goats six months and older, B. dentium and B. gallicum were predominant. In some goats however, the specific strains could not be identified with the currently available primers indicating there are goat specific unique strains that are yet to be characterized. Further research to characterize and isolate Bifidobacterium in goats are needed for future probiotic applications. In conclusion, Bifidobacterium spp. were common in all age groups of pastured goats but more abundant in pre-weaned goats compared to goats over six months. In addition age related differences in the diversity of Bifidobacterium spp. in goats were reported.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».