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Enregistrement W4221051037 · doi:10.5539/jas.v14n4p51

Molecular Detection of Age-Related Abundance and Diversity of Bifidobacterium spp. in Pastured Goats

2022· article· en· W4221051037 sur OpenAlexvenueno aff
Eunice Ndegwa, Ako Agyemang

Notice bibliographique

RevueJournal of Agricultural Science · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Food and AgricultureU.S. Department of Agriculture
Mots-clésBifidobacteriumBiologyBifidobacterium animalisFecesVeterinary medicineLactobacillusMicrobiologyBacteriaMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bifidobacterium spp. are among bacteria being developed as probiotics for farm animals. Understanding diversity of the normal gut inhabitants is a prerequisite to developing species-specific probiotics strains that are likely to establish in the host. For many farm animals including goats, the normal gut Bifidobacterium inhabitants have not been characterized including age based differences. The objective of this exploratory study was to gain preliminary understanding of abundance and diversity of Bifidobacterium species in goats of different ages. Molecular methods have given scientists fast methods for exploratory insights into previously uncharacterized microbiomes. Consequently, in this study we utilized molecular assays using genus and species specific primers to characterize Bifidobacterium in pastured goats. Although Bifidobacterium were detected in all ages, younger animals had higher counts than older goats. In goats below six months of age, B. angulatum, B. dentium, B. gallicum, B. animalis sub animalis, B. longum and B. catenulatum were detected. In goats six months and older, B. dentium and B. gallicum were predominant. In some goats however, the specific strains could not be identified with the currently available primers indicating there are goat specific unique strains that are yet to be characterized. Further research to characterize and isolate Bifidobacterium in goats are needed for future probiotic applications. In conclusion, Bifidobacterium spp. were common in all age groups of pastured goats but more abundant in pre-weaned goats compared to goats over six months. In addition age related differences in the diversity of Bifidobacterium spp. in goats were reported.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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