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Enregistrement W4221056368 · doi:10.1139/gen-2021-0059

The plastome of Arctic<i>Oxytropis arctobia</i>(Fabaceae) is significantly different from that of<i>O. splendens</i>and other related species

2022· article· en· W4221056368 sur OpenAlexafffundvenue
Juan C. Camargo Tavares, Sai Reddy Achakkagari, Annie Archambault, Martina V. Strömvik

Notice bibliographique

RevueGenome · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Taxonomy and Phylogenetics
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaConsejo Nacional de Ciencia y TecnologíaGénome QuébecCompute Canada
Mots-clésBiologyFabaceaeChloroplast DNABotanyCladeGenusEvolutionary biologyPhylogeneticsGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Anatomical and physiological specializations for plant adaptation to harsh climates result from molecular mechanisms that can be encoded in the nucleus or organelle. In this study, the complete plastomes of an arctic species, Oxytropis arctobia Bunge (Fabaceae), and a closely related temperate species, O. splendens Douglas ex Hook., were assembled, annotated, and analyzed to identify differences that might help explain their adaptation to different environments. This is consistent with the previously sequenced O. bicolor DC. and O. glabra plastomes, O. arctobia and O. splendens plastomes both have the common features of the inverted repeat-lacking clade (IRLC), as well as atpF intron loss, which is unique to the genus. However, significant differences were observed between the plastomes of O. arctobia and O. splendens and other closely related species (Oxytropis spp. and Astragalus spp.), including a 3 kb inversion, two large insertions (&gt;1 kb), significant modifications of the accD gene, and an overall larger size.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,928
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,175
Écart entre enseignants0,151 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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