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Enregistrement W4221058334 · doi:10.1101/2022.03.27.486008

A complete MAPK cascade, a calmodulin, and a protein phosphatase act downstream of CRK receptor kinases and regulate <i>Arabidopsis</i> innate immunity

2022· preprint· en· W4221058334 sur OpenAlexafffund
Fangwen Bai, Johannes W. Stratmann, Daniel P. Matton

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaChina Scholarship Council
Mots-clésMAPK cascadeMAPK/ERK pathwayPseudomonas syringaeArabidopsisKinaseBiologyCell biologyMAP kinase kinase kinaseAdapter molecule crkPhosphataseProtein kinase ASignal transductionMitogen-activated protein kinase kinaseInnate immune systemPhosphorylationBiochemistrySignal transducing adaptor proteinReceptorMicrobiologyPathogenMutantGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Mitogen-activated protein kinase (MAPK) cascades are critical signal transduction modules in stress responses, but how their composition and mode of activation induces a stress response is poorly understood. We showed in Arabidopsis that CRK21, a cysteine-rich receptor-like protein kinase (CRK), phosphorylates MAPK kinase kinase 20 (MKKK20) and thus directly activates a novel MAPK cascade, consisting of MKKK20, the MAPK kinase MKK3, and the MAPK MPK6. Furthermore, the protein phosphatase PP2C76 and the calmodulin CaM7 were identified as negative and positive modulators of the cascade, respectively. Loss-of-function in components of the MAPK cascade or in CaM7 led to susceptibility to the bacterial pathogen Pseudomonas syringae and the fungal pathogen Botrytis cinerea . In contrast, loss-of-function of PP2C76 as well as transient overexpression of the genes in the MAPK cascade and CaM7 conferred resistance to the pathogens. Moreover, seven additional CRKs interacted with MKKK20 in vivo , and four of these were highly expressed after inoculation with P. syringae . In summary, our findings demonstrate that the novel CRK21-MKKK20-MKK3-MPK6 signaling pathway functions in immunity to fungal and bacterial pathogens and that CRKs may function in directly activating MKKKs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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