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Enregistrement W4221071329 · doi:10.1016/j.jlr.2022.100204

A high-throughput platform for the rapid screening of vitamin D status by direct infusion-MS/MS

2022· article· en· W4221071329 sur OpenAlexafffund
Erick Helmeczi, Eric Fries, Lauren M. Perry, Karen Choong, Katie O’Hearn, Dayre McNally, Philip Britz‐McKibbin

Notice bibliographique

RevueJournal of Lipid Research · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVitamin D Research Studies
Établissements canadiensUniversity of OttawaChildren's Hospital of Eastern OntarioMcMaster University
Organismes subventionnairesInstitute of Population and Public HealthGenome CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCanada Foundation for InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcMaster UniversityPhysicians' Services Incorporated Foundation
Mots-clésCoefficient of variationChromatographyVitamin D and neurologyImmunoassayDetection limitMedicineInternal medicineChemistryImmunologyAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vitamin D is an important fat-soluble prohormone with pleiotropic effects on human health, such as immunomodulation of the innate and adaptive immune system. There is an unmet clinical need for a rapid screening platform for 25-hydroxyvitamin D (25OH-D) determination without chromatographic separation that offers better precision and accuracy than immunoassays. Here, we introduce a high-throughput method for assessing vitamin D status from blood specimens based on direct infusion-MS/MS (DI-MS/MS) following click derivatization using 2-nitrosopyridine. We developed an optimized liquid-phase extraction protocol to minimize ion suppression when directly infusing serum or plasma extracts via a capillary electrophoresis system for quantitative determination of 25OH-D. Acceptable reproducibility (mean coefficient of variation = 10.9%, n = 412), recovery (mean = 102% at 15, 30, and 45 nmol/l), and linearity ( R 2 > 0.998) were achieved for 25OH-D with lower detection limits (limit of detection ∼1.2 nmol/l, S/N ∼ 3), greater throughput (∼3 min/sample), and less bias than a commercial chemiluminescence immunoassay prone to batch effects. There was mutual agreement in 25OH-D concentrations from reference blood samples measured by DI-MS/MS as compared with LC-MS/MS (mean bias = 7.8%, n = 18). We also demonstrate that this method could reduce immunoassay misclassification of vitamin D deficiency in a cohort of critically ill children ( n = 30). In conclusion, DI-MS/MS offers a viable alternative to LC-MS/MS for assessment of vitamin D status in support of large-scale studies in nutritional epidemiology as well as clinical trials to rapidly screen individual patients who may benefit from vitamin D supplementation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,077
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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