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Enregistrement W4221073563 · doi:10.1016/j.soilbio.2022.108618

Linking soil microbial community structure to potential carbon mineralization: A continental scale assessment of reduced tillage

2022· article· en· W4221073563 sur OpenAlexaff
Elizabeth L. Rieke, Shannon B. Cappellazzi, Michael Cope, Daniel Liptzin, G. Mac Bean, Kelsey L.H. Greub, Charlotte E. Norris, P. W. Tracy, Ezra Aberle, Amanda J. Ashworth, Oscar Bañuelos Tavarez, Andy I. Bary, R. Louis Baumhardt, Alberto Borbón Gracia, Daniel C. Brainard, Jameson R Brennan, Dolores Briones Reyes, Darren Bruhjell, Cameron N. Carlyle, James J.W. Crawford, Cody F. Creech, Steve W. Culman, Bill Deen, Curtis J. Dell, Justin Derner, Thomas F. Ducey, Sjoerd W. Duiker, Miles Dyck, Benjamin H. Ellert, Avelino Espinosa Solorio, Steven J. Fonte, Simon Fonteyne, Ann‐Marie Fortuna, Jamie L. Foster, Lisa M. Fultz, Audrey V. Gamble, Charles M. Geddes, Deirdre Griffin‐LaHue, John H. Grove, Stephen K. Hamilton, Xiying Hao, Zachary D. Hayden, Nora Honsdorf, Julie A. Howe, James A. Ippolito, Gregg A. Johnson, Mark A. Kautz, Newell R. Kitchen, Sandeep Kumar, Kirsten S.M. Kurtz, Francis J. Larney, Katie L. Lewis, Matt Liebman, Antonio López Ramírez, Stephen Machado, Bijesh Maharjan, Miguel Ángel Martínez Gamiño, William E. May, Mitchel P. McClaran, Marshall D. McDaniel, N. Millar, Jeffrey P. Mitchell, Amber Moore, P. Moore, Manuel Mora Gutiérrez, Kelly A. Nelson, Emmanuel C. Omondi, Shannon L. Osborne, Leodegario Osorio Alcalá, Philip Owens, E. M. Pena‐Yewtukhiw, Hanna Poffenbarger, Brenda Ponce Lira, Jennifer R. Reeve, Timothy M. Reinbott, Mark S. Reiter, Edwin L. Ritchey, Kraig L. Roozeboom, Yichao Rui, Amir Sadeghpour, Upendra M. Sainju, Gregg R. Sanford, William F. Schillinger, Robert R. Schindelbeck, Meagan E. Schipanski, Alan J. Schlegel, Kate M. Scow, Lucretia A. Sherrod, Amy L. Shober, Sudeep S. Sidhu, Ernesto Solís Moya, Mervin St. Luce, Jeffrey S. Strock, Andrew E. Suyker, Virginia R. Sykes, Haiying Tao, Alberto Trujillo Campos, Laura L. Van Eerd, Nele Verhulst, Tony J. Vyn, Yutao Wang, Dexter B. Watts, Bryan B. William, David L. Wright, Tiequan Zhang, Cristine L.S. Morgan, C. Wayne Honeycutt

Notice bibliographique

RevueSoil Biology and Biochemistry · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoil Carbon and Nitrogen Dynamics
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity of AlbertaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesFoundation for Food and Agriculture ResearchGeneral MillsSamuel Roberts Noble Foundation
Mots-clésCminEnvironmental scienceSoil waterMicrobial population biologyMineralization (soil science)Disturbance (geology)Soil carbonEcologyBiologySoil science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Potential carbon mineralization (Cmin) is a commonly used indicator of soil health, with greater Cmin values interpreted as healthier soil. While Cmin values are typically greater in agricultural soils managed with minimal physical disturbance, the mechanisms driving the increases remain poorly understood. This study assessed bacterial and archaeal community structure and potential microbial drivers of Cmin in soils maintained under various degrees of physical disturbance. Potential carbon mineralization, 16S rRNA sequences, and soil characterization data were collected as part of the North American Project to Evaluate Soil Health Measurements (NAPESHM). Results showed that type of cropping system, intensity of physical disturbance, and soil pH influenced microbial sensitivity to physical disturbance. Furthermore, 28% of amplicon sequence variants (ASVs), which were important in modeling Cmin, were enriched under soils managed with minimal physical disturbance. Sequences identified as enriched under minimal disturbance and important for modeling Cmin, were linked to organisms which could produce extracellular polymeric substances and contained metabolic strategies suited for tolerating environmental stressors. Understanding how physical disturbance shapes microbial communities across climates and inherent soil properties and drives changes in Cmin provides the context necessary to evaluate management impacts on standardized measures of soil microbial activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,098
Score d'incertitude au seuil0,291

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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