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Enregistrement W4221114436 · doi:10.1101/2022.03.30.486436

Obligate sexual reproduction of a homothallic fungus closely related to the <i>Cryptococcus</i> pathogenic species complex

2022· preprint· en· W4221114436 sur OpenAlexfundno aff
Andrew Ryan Passer, Shelly Applen Clancey, Terrance Shea, Márcia David‐Palma, Anna Floyd Averette, Teun Boekhout, Betina M. Porcel, Minou Nowrousian, Christina A. Cuomo, Sheng Sun, Joseph Heitman, Marco A. Coelho

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYeasts and Rust Fungi Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteNational Institutes of HealthDeutsche ForschungsgemeinschaftNorth Carolina State UniversityNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesBroad InstituteCanadian Institute for Advanced Research
Mots-clésBiologyHomothallismMating typeHeterothallicSexual reproductionObligateCryptococcus neoformansGeneticsCryptococcusCryptococcus gattiiSyntenyBasidiumEvolutionary biologyGeneGenomeHyphaMicrobiologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Sexual reproduction is a ubiquitous and ancient trait of eukaryotic life. While sexual organisms are usually faced with the challenge of finding a compatible mating partner, species as diverse as animals, plants, and fungi have repeatedly evolved the ability to reproduce sexually without an obligate requirement for another individual. Here, we uncovered the underlying mechanism of self-compatibility (homothallism) in Cryptococcus depauperatus , a fungal species sister to the clinically relevant human fungal pathogens Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii species complexes. In contrast to C. neoformans or C. gattii , which grow as a yeast in the asexual stage, and produce hyphae, basidia, and infectious spores during the sexual stage, C. depauperatus grows exclusively as hyphae decorated with basidia and abundant spores and appears to be continuously engaged in sexual reproduction. By combining the insights from comparative genomics and genetic analyses of mutants defective in key mating and meiosis genes, we demonstrate the sexual cycle of C. depauperatus involves meiosis, and reveal that self-compatibility is orchestrated by the expression, in the same cell, of an unlinked mating receptor (Ste3 a ) and pheromone ligand (MFα) pair seemingly derived from opposite mating types of a heterothallic (self-sterile) ancestor. We identified a putative mating-type ( MAT ) determining region containing genes phylogenetically aligned with MAT a alleles of other species, and a few MAT α gene alleles scattered and unlinked throughout the genome, but no homologs of the mating-type homeodomain genes SXI1 ( HD1 ) and SXI2 ( HD2 ). Comparative genomic analyses suggested a dramatic remodeling of the MAT locus possibly owing to reduced selective constraints to maintain mating-type genes in tight linkage, associated with a transition to self-fertility. Our findings support C. depauperatus as an obligately sexual, homothallic fungal species and provide additional insight into the repeated transitions between modes of sexual reproduction that have occurred throughout the fungal kingdom.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,653
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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