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Enregistrement W4221116496 · doi:10.1002/9781118960608.gbm02023

<i>Oleiharenicola</i>

2022· other· en· W4221116496 sur OpenAlexaff
Fauziah F. Rochman, Triet Tran, Peter F. Dunfield

Notice bibliographique

RevueBergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria · 2022
Typeother
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBacteriaGenus16S ribosomal RNABotanyBiologyChemistryFood sciencePaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract O.le.i.ha.re.ni ' co.la. L. neut. n. oleum , oil; L. fem. n. harena , sand; L. suffix ‐ cola , inhabitant, dweller; N.L. masc. n. Oleiharenicola defines an inhabitant of oil sands wastewater. The genus Oleiharenicola consists of two described species of strictly aerobic chemoorganotrophic bacteria: Oleiharenicola alkalitolerans and Oleiharenicola lentus . Cells are Gram‐negative, non‐spore‐forming, and nonpigmented cocci or diplococci (0.5–1.5 μm in diameter). The two species, and some closely related strains described in nontaxonomic literature, were all isolated from terrestrial freshwater or wastewater environments. The type strain Oleiharenicola alkalitolerans NVT T was isolated from the tailings pond of an oil sands mining operation (hence the genus name), and Oleiharenicola lentus TWA‐58 T from agricultural irrigation water, while closely related bacteria (originally dubbed “Lacunisphaera,” but probably Oleiharenicola spp.) have also been isolated from a freshwater lake. Bacteria of the genus Oleiharenicola are mesophilic (optimum 25–37°C) and neutrophilic (optimum pH 6–8), but O. alkalitolerans tolerates alkaline conditions up to pH 11. Cells reproduce by normal cell division and occur mainly as single cells or pairs. Their carbon and energy sources include several sugars, polysaccharides, and organic acids. The DNA G + C content is 65.3–66.1 mol%. The major isoprenoid quinone is MK‐7, while anteiso‐C 15:0 and iso‐C 15:0 are the major cellular fatty acids. Analysis of 16S rRNA gene sequences revealed that the genus belongs to the family Opitutaceae of the phylum Verrucomicrobiota . DNA G + C content (mol%) : 65.3–66.1. Type species : Oleiharenicola alkalitolerans Rochman et al. 2018 VP . Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the genus Oleiharenicola is: correct name (last update, February 2025) * . LPSN classification: Bacteria / Pseudomonadati / Verrucomicrobiota / Opitutia / Opitutales / Opitutaceae / Oleiharenicola The genus Oleiharenicola can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as g__Lacunisphaera (version v220) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Verrucomicrobiota / c__Verrucomicrobiae / o__Opitutales / f__Opitutaceae / g__Lacunisphaera * Meier‐Kolthoff et al. ( 2022 ). Nucleic Acids Res , 50 , D801 – D807 ; DOI: 10.1093/nar/gkab902 ** Parks

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,218
Score d'incertitude au seuil0,961

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0400,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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