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Enregistrement W4223463368 · doi:10.3390/pharmaceutics14040828

Towards Selective Binding to the GLUT5 Transporter: Synthesis, Molecular Dynamics and In Vitro Evaluation of Novel C-3-Modified 2,5-Anhydro-D-mannitol Analogs

2022· article· en· W4223463368 sur OpenAlexafffund
Natasha Rana, M. Abdel Aziz, Ahmed K. Oraby, Melinda Wuest, Jennifer Dufour, Khaled A. M. Abouzid, Frank Wuest, F. G. West

Notice bibliographique

RevuePharmaceutics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiet, Metabolism, and Disease
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Glycomics Network
Mots-clésMannitolIn vitroChemistryTransporterD-mannitolMolecular dynamicsBiochemistryStereochemistryGeneComputational chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Deregulation and changes in energy metabolism are emergent and important biomarkers of cancer cells. The uptake of hexoses in cancer cells is mediated by a family of facilitative hexose membrane-transporter proteins known as Glucose Transporters (GLUTs). In the clinic, numerous breast cancers do not show elevated glucose metabolism (which is mediated mainly through the GLUT1 transporter) and may use fructose as an alternative energy source. The principal fructose transporter in most cancer cells is GLUT5, and its mRNA was shown to be elevated in human breast cancer. This offers an alternative strategy for early detection using fructose analogs. In order to selectively scout GLUT5 binding-pocket requirements, we designed, synthesized and screened a new class of fructose mimics based upon the 2,5-anhydromannitol scaffold. Several of these compounds display low millimolar IC50 values against the known high-affinity 18F-labeled fructose-based probe 6-deoxy-6-fluoro-D-fructose (6-FDF) in murine EMT6 breast cancer cells. In addition, this work used molecular docking and molecular dynamics simulations (MD) with previously reported GLUT5 structures to gain better insight into hexose–GLUT interactions with selected ligands governing their preference for GLUT5 compared to other GLUTs. The improved inhibition of these compounds, and the refined model for their binding, set the stage for the development of high-affinity molecular imaging probes targeting cancers that express the GLUT5 biomarker.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,690
Score d'incertitude au seuil0,586

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,367
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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