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Enregistrement W4223487063 · doi:10.1073/pnas.2113561119

Evaluation of individual and ensemble probabilistic forecasts of COVID-19 mortality in the United States

2022· article· en· W4223487063 sur OpenAlexafffund
Estee Y. Cramer, Evan L Ray, Velma K. Lopez, Johannes Bracher, Andrea Brennen, Alvaro J. Castro Rivadeneira, Aaron Gerding, Tilmann Gneiting, Katie House, Yuxin Huang, Abdul Hannan Kanji, Ayush Khandelwal, Khoa Le, Anja Mühlemann, Jarad Niemi, Apurv Shah, Ariane Stark, Yijin Wang, Nutcha Wattanachit, Martha Zorn, Youyang Gu, Sansiddh Jain, Nayana Bannur, Ayush Deva, Mihir Kulkarni, Srujana Merugu, Alpan Raval, Siddhant Shingi, Avtansh Tiwari, Jerome White, Neil F. Abernethy, Spencer Woody, Maytal Dahan, Spencer J. Fox, Kelly Gaither, Michael Lachmann, Lauren Ancel Meyers, James G. Scott, Mauricio Tec, Ajitesh Srivastava, Glover George, Jeffrey C. Cegan, Ian Dettwiller, William P. England, Matthew W. Farthing, Robert H. Hunter, Brandon J. Lafferty, Igor Linkov, Michael L. Mayo, Matthew Parno, Michael A. Rowland, Benjamin D. Trump, Yanli Zhang‐James, Samuel Chen, Stephen V. Faraone, Jonathan Hess, Christopher P. Morley, Asif Salekin, Dongliang Wang, Sabrina Corsetti, T. M. Baer, Marisa C. Eisenberg, Karl Falb, Yitao Huang, Emily T. Martin, Ella McCauley, Robert L. Myers, Tom Schwarz, Daniel Sheldon, Graham Gibson, Rose Yu, Liyao Gao, Yi-An Ma, Dongxia Wu, Xifeng Yan, Xiaoyong Jin, Yu-Xiang Wang, YangQuan Chen, Lihong Guo, Yanting Zhao, Quanquan Gu, Jinghui Chen, Lingxiao Wang, Pan Xu, Weitong Zhang, Difan Zou, Hannah Biegel, J. Lega, Steve McConnell, VP Nagraj, Stephanie Guertin, Christopher Hulme-Lowe, Stephen Turner, Yunfeng Shi, Xuegang Ban, Robert Walraven, Qi‐Jun Hong, Stanley Kong, Axel van de Walle, James Turtle, M. Ben-Nun, Steven Riley, Pete Riley, Ugur Koyluoglu, David DesRoches, Pedro Forli, Bruce H. Hamory, Christina Kyriakides, Helen Leis, John Milliken, Michael Moloney, James Morgan, Ninad Nirgudkar, Gokce Ozcan, Noah Piwonka, Matt Ravi, Chris Schrader, Elizabeth A. Shakhnovich, Daniel M. Siegel, Ryan Spatz, Chris Stiefeling, Barrie Wilkinson, Alexander Wong, Sean Cavany, Guido España, Sean M. Moore, Rachel J. Oidtman, T. Alex Perkins, David Kraus, Andrea Kraus, Zhifeng Gao, Jiang Bian, Wei Cao, Juan Lavista Ferres, Chaozhuo Li, Tie‐Yan Liu, Xing Xie, Shun Zhang, Shun Zheng, Alessandro Vespignani, Matteo Chinazzi, Jessica T. Davis, Kunpeng Mu, Ana Pastore y Piontti, Xinyue Xiong, Andrew Zheng, Jackie Baek, Vivek F. Farias, Andreea Georgescu, Retsef Levi, Deeksha Sinha, Joshua Wilde, Georgia Perakis, Mohammed Amine Bennouna, David Nze Ndong, Divya Singhvi, Ιoannis Spantidakis, Leann Thayaparan, Asterios Tsiourvas, Arnab Sarker, Ali Jadbabaie, Devavrat Shah, Nicolás Della Penna, Leo Anthony Celi, Saketh Sundar, Russ Wolfinger, Dave Osthus, Lauren Castro, Geoffrey Fairchild, Isaac Michaud, D. Karlen, Matt Kinsey, Luke C. Mullany, Kaitlin Rainwater‐Lovett, Lauren Shin, Katharine Tallaksen, Shelby Wilson, Elizabeth C. Lee, Juan Dent, Kyra H. Grantz, Alison L. Hill, Joshua Kaminsky, Kathryn Kaminsky, Lindsay T. Keegan, Stephen A. Lauer, Joseph C. Lemaitre, Justin Lessler, Hannah R. Meredith, Javier Perez‐Saez, Sam Shah, Claire P. Smith, Shaun Truelove, Josh Wills, Maximilian Marshall, Lauren Gardner, Kristen Nixon, John C. Burant, Li Wang, Lei Gao, Zhiling Gu, Myungjin Kim, Xinyi Li, Guannan Wang, Yueying Wang, Shan Yu, Robert C. Reiner, Ryan M Barber, Emmanuela Gakidou, Simon I Hay, Steve Lim, Chris Murray, David M. Pigott, Heidi Gurung, Prasith Baccam, Steven A. Stage, Bradley T. Suchoski, B. Aditya Prakash, Bijaya Adhikari, Jiaming Cui, Alexander Rodríguez, Anika Tabassum, Jiajia Xie, Pınar Keskinocak, John Asplund, Arden Baxter, Buse Eylul Oruc, Nicoleta Serban, Sercan Ö. Arık, Mike Dusenberry, Arkady Epshteyn, Elli Kanal, Long Tan Le, Chunliang Li, Tomas Pfister, Dario Sava, Rajarishi Sinha, Thomas C. Tsai, Nathanael C. Yoder, Jinsung Yoon, Leyou Zhang, Sam Abbott, Nikos I Bosse, Sebastian Funk, Joel Hellewell, Sophie Meakin, Katharine Sherratt, Mingyuan Zhou, Rahi Kalantari, Teresa K. Yamana, Sen Pei, Jeffrey Shaman, Michael Lingzhi Li, Dimitris Bertsimas, Omar Skali Lami, Soni Saksham, Hamza Tazi Bouardi, Turgay Ayer, Madeline Adee, Jagpreet Chhatwal, Özden O. Dalgıç, Mary A. Ladd, Benjamin P. Linas, Peter P. Mueller, Jade Xiao, Yuanjia Wang, Qinxia Wang, Shanghong Xie, Donglin Zeng, Alden Green, Jacob Bien, Logan Brooks, Addison J. Hu, Maria Jahja, Daniel J. McDonald, Balasubramanian Narasimhan, Collin A. Politsch, Samyak Rajanala, Aaron Rumack, Noah Simon, Ryan J. Tibshirani, Rob Tibshirani, Valérie Ventura, Larry Wasserman, Eamon B. O’Dea, John M. Drake, Roberto Pagano, Ngoc Quoc Tran, Lam Si Tung Ho, Huong Huynh, Jo Walker, Rachel B. Slayton, Michael A. Johansson, Matthew Biggerstaff, Nicholas G Reich

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueCOVID-19 epidemiological studies
Établissements canadiensDalhousie UniversityUniversity of British ColumbiaUniversity of VictoriaTRIUMF
Organismes subventionnairesEngineer Research and Development CenterLos Alamos National LaboratoryCenters for Disease Control and PreventionNational Institute of General Medical SciencesMedical Research CouncilWinship Cancer InstituteBrown UniversitySloan School of Management, Massachusetts Institute of TechnologyUniversity of WashingtonUniversity of California, Los AngelesState University of New York Upstate Medical UniversityUniversity of California, Santa BarbaraDepartment of Internal Medicine, University of UtahDepartment of Psychiatry, Columbia UniversityJohns Hopkins Bloomberg School of Public HealthJohns Hopkins UniversityUniversity of California, San DiegoHarvard UniversityUniversity of North Carolina at Chapel HillMasarykova UniverzitaPeople's Government of Jilin ProvinceDirectorate for Biological SciencesDalhousie UniversityImperial College LondonNational Institute for Health and Care ResearchYork UniversityInstitute for Health Metrics and EvaluationUniversity of Science and Technology of ChinaRensselaer Polytechnic InstituteInstitute for Scientific InterchangeSanta Fe InstituteUniversity of Texas at AustinCarnegie Mellon UniversityIowa State UniversityUniversity of Notre DameUniversity of Southern CaliforniaTRIUMFArizona State UniversityMassachusetts Institute of TechnologySchool of Medicine, Boston UniversityJilin UniversitySyracuse UniversityEmory UniversityUniversity of BernGeorgia Institute of TechnologyClemson UniversityWellcome TrustMassachusetts General Hospital
Mots-clésProbabilistic logicStaffingGeospatial analysisCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Baseline (sea)Actuarial scienceOperations researchPublic healthComputer scienceEconometricsStatisticsBusinessGeographyMedicineEconomicsEngineeringPolitical scienceMathematicsArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Short-term probabilistic forecasts of the trajectory of the COVID-19 pandemic in the United States have served as a visible and important communication channel between the scientific modeling community and both the general public and decision-makers. Forecasting models provide specific, quantitative, and evaluable predictions that inform short-term decisions such as healthcare staffing needs, school closures, and allocation of medical supplies. Starting in April 2020, the US COVID-19 Forecast Hub (https://covid19forecasthub.org/) collected, disseminated, and synthesized tens of millions of specific predictions from more than 90 different academic, industry, and independent research groups. A multimodel ensemble forecast that combined predictions from dozens of groups every week provided the most consistently accurate probabilistic forecasts of incident deaths due to COVID-19 at the state and national level from April 2020 through October 2021. The performance of 27 individual models that submitted complete forecasts of COVID-19 deaths consistently throughout this year showed high variability in forecast skill across time, geospatial units, and forecast horizons. Two-thirds of the models evaluated showed better accuracy than a naïve baseline model. Forecast accuracy degraded as models made predictions further into the future, with probabilistic error at a 20-wk horizon three to five times larger than when predicting at a 1-wk horizon. This project underscores the role that collaboration and active coordination between governmental public-health agencies, academic modeling teams, and industry partners can play in developing modern modeling capabilities to support local, state, and federal response to outbreaks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,074
Score d'incertitude au seuil0,146

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,509
Tête enseignante GPT0,485
Écart entre enseignants0,024 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations320
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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