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Enregistrement W4223645585 · doi:10.1126/sciadv.abm2094

Z-α <sub>1</sub> -antitrypsin polymers impose molecular filtration in the endoplasmic reticulum after undergoing phase transition to a solid state

2022· article· en· W4223645585 sur OpenAlexaff
Joseph E. Chambers, Nikita Zubkov, Markéta Kubánková, Jonathon Nixon‐Abell, Ioanna Mela, Susana Abreu, Max Schwiening, Giulia Lavarda, Ismael López‐Duarte, Jennifer A. Dickens, Tomás Torres⊗, Clemens F. Kaminski, Liam J. Holt, Edward Avezov, James A. Huntington, Peter St George‐Hyslop, Marina K. Kuimova, Stefan J. Marciniak

Notice bibliographique

RevueScience Advances · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteChan Zuckerberg InitiativeMedical Research CouncilPershing Square Sohn Cancer Research AllianceUniversity of OxfordNational Institutes of HealthGrifolsWellcome TrustImperial College LondonEngineering and Physical Sciences Research CouncilCambridge Institute for Medical Research, University of CambridgeUK Dementia Research InstituteAmerican Cancer Society
Mots-clésCalreticulinEndoplasmic reticulumUnfolded protein responseEndoplasmic-reticulum-associated protein degradationCalnexinATF6Chaperone (clinical)ChemistryBiophysicsCell biologyBiologyBiochemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Misfolding of secretory proteins in the endoplasmic reticulum (ER) features in many human diseases. In α 1 -antitrypsin deficiency, the pathogenic Z variant aberrantly assembles into polymers in the hepatocyte ER, leading to cirrhosis. We show that α 1 -antitrypsin polymers undergo a liquid:solid phase transition, forming a protein matrix that retards mobility of ER proteins by size-dependent molecular filtration. The Z-α 1 -antitrypsin phase transition is promoted during ER stress by an ATF6-mediated unfolded protein response. Furthermore, the ER chaperone calreticulin promotes Z-α 1 -antitrypsin solidification and increases protein matrix stiffness. Single-particle tracking reveals that solidification initiates in cells with normal ER morphology, previously assumed to represent a healthy pool. We show that Z-α 1 -antitrypsin–induced hypersensitivity to ER stress can be explained by immobilization of ER chaperones within the polymer matrix. This previously unidentified mechanism of ER dysfunction provides a template for understanding a diverse group of related proteinopathies and identifies ER chaperones as potential therapeutic targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,503

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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