Tight association between microbial eukaryote and giant virus communities in the Arctic Ocean
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Viruses are important regulatory factors of the marine microbial community including microeukaryotes. However, little is known about their role in the northern Chukchi Sea in the Arctic basin, which has oligotrophic conditions in summer. To clarify the link between microbial eukaryotic communities and viruses as well as environmental conditions, we investigated the community structures of microeukaryotes (from 3 to144 μm and from 0.23 μm size bio‐particles collected from seawater) and Imitervirales (from 0.23 μm size bio‐particles collected from seawater), a dominant group of viruses infecting marine microeukaryotes. To the best of our knowledge, no study has investigated both Imitervirales and eukaryotic communities in the Arctic Ocean. Surface water samples were collected at 21 ocean stations located in the northeastern Chukchi Sea and an adjacent area outside the Beaufort Gyre (Adjacent Sea), and at two melt ponds on sea ice in the summer of 2018. At the ocean stations, nutrient concentrations were low in most of the locations, except the shelf in the adjacent sea. The community variations were significantly correlated between eukaryotes and Imitervirales, even within the northeastern Chukchi Sea characterized by relatively homogeneous environmental conditions. The association of the eukaryotic community with the viral community was stronger than that with geographical and physicochemical environmental factors. These results suggest that Imitervirales actively infect their hosts even in the cold and oligotrophic seawater in the Arctic Ocean.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».