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Enregistrement W4224088275 · doi:10.3390/tomography8020091

Noise-Based Image Harmonization Significantly Increases Repeatability and Reproducibility of Radiomics Features in PET Images: A Phantom Study

2022· article· en· W4224088275 sur OpenAlexafffund
H. Keller, Tina Shek, Brandon Driscoll, Yiwen Xu, Brian Nghiem, Sadek A. Nehmeh, Milan Grkovski, C. Ross Schmidtlein, Mikalai M. Budzevich, Yoganand Balagurunathan, John J. Sunderland, Reinhard Beichel, Carlos Uribe, Ting‐Yim Lee, Fiona Li, David A. Jaffray, Ivan Yeung

Notice bibliographique

RevueTomography · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensWestern UniversityLawson Health Research InstituteBC Cancer AgencyUniversity Health NetworkUniversity of TorontoUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of IowaGeoffrey Beene Cancer Research CenterMemorial Sloan-Kettering Cancer Center
Mots-clésRepeatabilityImaging phantomReproducibilityArtificial intelligenceScannerRobustness (evolution)Feature (linguistics)Pattern recognition (psychology)Noise (video)Image noiseIntraclass correlationComputer scienceComputer visionImage textureImage processingMathematicsImage (mathematics)Nuclear medicineStatisticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

For multicenter clinical studies, characterizing the robustness of image-derived radiomics features is essential. Features calculated on PET images have been shown to be very sensitive to image noise. The purpose of this work was to investigate the efficacy of a relatively simple harmonization strategy on feature robustness and agreement. A purpose-built texture pattern phantom was scanned on 10 different PET scanners in 7 institutions with various different image acquisition and reconstruction protocols. An image harmonization technique based on equalizing a contrast-to-noise ratio was employed to generate a "harmonized" alongside a "standard" dataset for a reproducibility study. In addition, a repeatability study was performed with images from a single PET scanner of variable image noise, varying the binning time of the reconstruction. Feature agreement was measured using the intraclass correlation coefficient (ICC). In the repeatability study, 81/93 features had a lower ICC on the images with the highest image noise as compared to the images with the lowest image noise. Using the harmonized dataset significantly improved the feature agreement for five of the six investigated feature classes over the standard dataset. For three feature classes, high feature agreement corresponded with higher sensitivity to the different patterns, suggesting a way to select suitable features for predictive models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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