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Enregistrement W4224320666 · doi:10.3390/cells11091442

Differential Sensitivity of the Protein Translation Initiation Machinery and mTOR Signaling to MECP2 Gain- and Loss-of-Function Involves MeCP2 Isoform-Specific Homeostasis in the Brain

2022· article· en· W4224320666 sur OpenAlexafffund
Marjorie Buist, Nada El Tobgy, Danilo Shevkoplyas, Matthew Genung, Annan Ali Sher, Shervin Pejhan, Mojgan Rastegar

Notice bibliographique

RevueCells · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Rett Syndrome AssociationUniversity of Manitoba
Mots-clésMECP2BiologyGene isoformCell biologyTranslation (biology)Protein kinase BSignal transductionMessenger RNAGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Eukaryotic gene expression is controlled at multiple levels, including gene transcription and protein translation initiation. One molecule with key roles in both regulatory mechanisms is methyl CpG binding protein 2 (MeCP2). MECP2 gain- and loss-of-function mutations lead to Rett Syndrome and MECP2 Duplication Syndrome, respectively. To study MECP2 gain-of-function, we generated stably transduced human brain cells using lentiviral vectors for both MECP2E1 and MECP2E2 isoforms. Stable overexpression was confirmed by Western blot and immunofluorescence. We assessed the impact of MeCP2E1-E2 gain-of-function on the MeCP2 homeostasis regulatory network (MECP2E1/E2-BDNF/BDNF-miR-132), mTOR-AKT signaling, ribosome biogenesis, markers of chromatin structure, and protein translation initiation. We observed that combined co-transduction of MeCP2 isoforms led to protein degradation of MeCP2E1. Proteosome inhibition by MG132 treatment recovered MeCP2E1 protein within an hour, suggesting its induced degradation through the proteosome pathway. No significant change was detected for translation initiation factors as a result of MeCP2E1, MeCP2E2, or combined overexpression of both isoforms. In contrast, analysis of human Rett Syndrome brains tissues compared with controls indicated impaired protein translation initiation, suggesting that such mechanisms may have differential sensitivity to MECP2 gain- and loss-of-function. Collectively, our results provide further insight towards the dose-dependent functional role of MeCP2 isoforms in the human brain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,070
Score d'incertitude au seuil0,228

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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