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Enregistrement W4225140144 · doi:10.3389/fsysb.2022.893007

A Metataxonomic Analysis of Maple Sap Microbial Communities Reveals New Insights Into Maple Syrup Complexity

2022· article· en· W4225140144 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Systems Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiquePlant-Derived Bioactive Compounds
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacs
Mots-clésMapleDormancyBiologyMaple syrup urine diseaseFood scienceBotanyAmino acidBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Maple syrup, an emblematic food product of Canada is produced from the concentration of sap collected from maple trees during spring. During this season, the trees come out of dormancy, which modifies sap composition. Meanwhile, microorganisms that contaminate sap as it is collected can also modify its composition. As these two factors can impact the quality of maple syrup, we aimed to better understand how microbial communities vary along dormancy release. We estimated the absolute abundance of bacteria and fungi in maple sap along a dormancy release index using high-throughput amplicon sequencing and digital droplet PCR (ddPCR). Several members were identified as indicators of maple sap composition, syrup organoleptic conformity and color, some of which are also hubs in the microbial association networks. We further explored bacterial communities by performing a predictive functional analysis, revealing various metabolic pathways correlated to dormancy release. Finally, we performed an experimental investigation of maple sap carrying capacity and limiting nutrients along dormancy release and found that maple sap composition variation influences its carrying capacity. Taken together, our results indicate that an increase in nitrogen supply in the form of allantoate combined with possible metabolite excretion could lead microbial communities towards different paths. Indeed, we observed a greater heterogeneity during late dormancy release which in turn could explain the variation in maple syrup quality. Further experimental investigation into the contribution of microbial, vegetal, environmental, technological, and processing factors to the final composition of maple syrup will be required to improve our understanding of this complex and flavorful food matrix and to develop quality control strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,667
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle