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Enregistrement W4225149283 · doi:10.1155/2022/8078259

[Retracted] Discovering Common Pathophysiological Processes between COVID‐19 and Cystic Fibrosis by Differential Gene Expression Pattern Analysis

2022· article· en· W4225149283 sur OpenAlexafffund
Md. Tanvir Hasan, Lway Faisal Abdulrazak, Mohammad Khursheed Alam, Md. Rezwan Islam, Yeasmin Hena Sathi, Fahad Ahmed Al-Zahrani, Kawsar Ahmed, Francis M. Bui, Mohammad Ali Moni

Dossier post-publication

NatureRetraction
MotifConcerns/Issues about Data;Concerns/Issues about Results and/or Conclusions;Concerns/Issues about Referencing/Attributions;Concerns/Issues about Peer Review;Investigation by Journal/Publisher;Investigation by Third Party;Paper Mill;Computer-Aided Content or Computer-Generated Content;Unreliable Results and/or Conclusions;
Date3/20/2024 0:00
Signalé par OpenAlex ?Oui

Source : Retraction Watch, jointe par DOI. OpenAlex consigne la rétractation dans is_retracted, un booléen sur un espace d'états à au moins quatre valeurs ; il ne peut donc exprimer ni une expression de préoccupation, ni une correction, ni un rétablissement, et les rapporte comme false, ce qui se lit comme « rien à signaler ».

Notice bibliographique

RevueBioMed Research International · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUmm Al-Qura University
Mots-clésPathophysiologyCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Gene expressionCystic fibrosisGeneSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Differential diagnosisBiology2019-20 coronavirus outbreakComputational biologyPathologyMedicineBioinformaticsGeneticsDiseaseInfectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Coronaviruses are a family of viruses that infect mammals and birds. Coronaviruses cause infections of the respiratory system in humans, which can be minor or fatal. A comparative transcriptomic analysis has been performed to establish essential profiles of the gene expression of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) linked to cystic fibrosis (CF). Transcriptomic studies have been carried out in relation to SARS-CoV-2 since a number of people have been diagnosed with CF. The recognition of differentially expressed genes demonstrated 8 concordant genes shared between the SARS-CoV-2 and CF. Extensive gene ontology analysis and the discovery of pathway enrichment demonstrated SARS-CoV-2 response to CF. The gene ontological terms and pathway enrichment mechanisms derived from this research may affect the production of successful drugs, especially for the people with the following disorder. Identification of TF-miRNA association network reveals the interconnection between TF genes and miRNAs, which may be effective to reveal the other influenced disease that occurs for SARS-CoV-2 to CF. The enrichment of pathways reveals SARS-CoV-2-associated CF mostly engaged with the type of innate immune system, Toll-like receptor signaling pathway, pantothenate and CoA biosynthesis, allograft rejection, graft-versus-host disease, intestinal immune network for IgA production, mineral absorption, autoimmune thyroid disease, legionellosis, viral myocarditis, inflammatory bowel disease (IBD), etc. The drug compound identification demonstrates that the drug targets of IMIQUIMOD and raloxifene are the most significant with the significant hub DEGs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,077
Score d'incertitude au seuil0,256

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0040,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0770,035

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,394
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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