D230025D16Rik: A Novel Regulator of Muscle Cell Differentiation
Notice bibliographique
Résumé
Rationale Loss of skeletal muscle mass and function is a common clinical feature and poor prognostic indicator in various diseases. A promising therapeutic approach of regenerative medicine for repair of skeletal muscle is through the delivery of cellular therapies targeting regulators of muscle regeneration (myogenesis). However, not all the proteins involved in this process have been identified. To address the gap in knowledge of proteins involved in myogenesis, we recently identified a novel gene, D230025D16Rik, which has never been characterized within the context of skeletal muscle growth and repair. Methods The role of D230025D16Rik in a C2C12 murine model of myoblast differentiation was assessed by using an siRNA loss‐of‐function approach. Differentiation of C2C12 myoblasts into myotubes in cells with intact D230025D16Rik and those with D230025D16Rik knockdown (KD) was determined by various experimental techniques, such as RT‐qPCR, microarray, immunofluorescence staining, and immunoblotting. Results D230025D16Rik has a mainly nuclear localization in myoblasts, whereas in myotubes, D230025D16Rik has both a nuclear and cytosolic localization. D230025D16Rik expression level is induced at the onset of differentiation (i.e., Day 1) and steadily increases as myoblasts fuse into myotubes. In response to D230025D16Rik KD, the expression of transcription factors MyoD1 and Myogenin and muscle‐specific transcripts Myosin Heavy Chain ( MyHC ) and Muscle Creatine Kinase ( MCK ) were upregulated such that a significant acceleration of myogenesis was observed. This observation was further confirmed by an analysis of transcriptomes of control and D230025D16Rik KD myoblasts that revealed an upregulation of myogenesis‐related transcripts in cells with D230025D16Rik KD. Phenotypically, we observe hypertrophic myotube formation at days 0 and 1 in response to D230025D16Rik KD, as indicated by immunofluorescence staining for MyHC. Finally, the presence of nuclear aggregates on D230025D16Rik KD myotubes indicates that D230025D16Rik is essential for proper myotube formation. Conclusion Altogether, these findings highlight, for the first time, the potential regulatory functions of D230025D16Rik during myogenesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».