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Enregistrement W4225379303 · doi:10.21203/rs.3.rs-1580079/v1

Control of human cytomegalovirus replication by liver resident natural killer cells

2022· preprint· en· W4225379303 sur OpenAlexaff
Calum Forrest, Thomas N. Chase, Antonia O. Cuff, Reza Motallebzadeh, Amir Gander, Brian R Davidson, Paul Griffiths, Victoria Male, Matthew B. Reeves

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesWellcome Trust
Mots-clésReplication (statistics)Human cytomegalovirusVirologyCytomegalovirusNatural (archaeology)Control (management)BiologyImmunologyComputer scienceHuman immunodeficiency virus (HIV)VirusHerpesviridaeArtificial intelligenceViral disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Natural killer (NK) cells are innate immune cells that have been suggested important for control of human cytomegalovirus (HCMV) – an important pathogen in immune suppressed transplant patients. In HCMV seropositive individuals a population of NK cells with adaptive features can expand in peripheral blood and has been shown to have enhanced antiviral function. This is particularly evident following solid organ transplant (SOT) where patients frequently experience episodes of HCMV viremia. In contrast, much less is understood about the identity and function of tissue-resident immune cells in the context of HCMV infection and pathogenesis. In this study, access to tissue-resident immune cells from human organs destined for transplant has enabled us to address this, for the first time. Here we show that human liver-resident (lrNK), like circulating NK (cNK) cells, express increased adaptive markers in HCMV+ individuals. Interestingly, lrNK demonstrated better control of HCMV replication in vitro when compared to cNK cells isolated from the same donor. Furthermore, this control phenotype was elevated if the cells were isolated from HCMV seropositive donors. Crucially, because these studies were performed on perfusates from livers destined for transplantation we could correlate a donor’s lrNK ability to control HCMV in vitro with a reduction in HCMV viraemia in liver transplant recipients in vivo. Finally, we demonstrate that a population of CD2+ NK cells are enriched in patients who did not develop viraemia post-transplant and that loss of control in vitro occurs when CD2 NK cells are depleted or inhibited with anti-CD2 antibodies. Therefore, lrNK have anti-viral activity that could be important for control of HCMV replication in tissue and contribute to better clinical outcomes following organ transplant. Understanding the importance of CD2 expressing populations could have implications for the development of novel therapies aimed at mobilising specific NK cell functions against infections and/or decreasing the ability of HCMV to evade NK responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,352
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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