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Enregistrement W4225380867 · doi:10.1096/fasebj.2022.36.s1.r2422

Identification of NUAK1/2 Regulators in the Hippo Signaling Pathway

2022· article· en· W4225380867 sur OpenAlexafffund
Youchen Song, Mandeep Gill, Siyuan Song, Liliana Attisano

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHippo pathway signaling and YAP/TAZ
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox Research Institute
Mots-clésHippo signaling pathwayCell biologyBiologyGene knockdownKinaseTranscription factorCell growthSignal transductionCancer researchCell cultureGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Hippo signaling pathway plays a central role in regulating cell proliferation, differentiation, and tissue size. In response to various upstream regulators, the mammalian STE20‐like protein kinase 1/2 (MST1/2) and large tumor suppressor kinase 1/2 (LATS1/2) phosphorylate Yes‐associated protein (YAP) and transcriptional co‐activator with PDZ‐binding motif (TAZ) to promote their cytoplasmic retention and degradation. Unphosphorylated YAP/TAZ translocate into the nucleus and interact with several transcription factors to regulate gene expression that drives cell growth and migration. Dysregulation of the Hippo pathway causes tissue overgrowth and tumorigenesis and elevated YAP/TAZ levels or activities are positively correlated with progression of almost all solid cancers. The NUAK family kinase 1/2 (NUAK1/2) are members of the AMP‐activated protein kinase‐related kinase family. Our lab showed that NUAK2 negatively regulates the Hippo pathway by preventing LATS‐mediated YAP/TAZ phosphorylation and cytoplasmic sequestration. Moreover, this work showed that loss of NUAK2 attenuates in vivo mammary tumor growth. However, how NUAK1/2 are regulated is poorly understood. Here, we will undertake screens in cancer cell lines to identify upstream and downstream NUAK1/2 regulators and partners. Since, abrogation of NUAK expression blocks cell growth in a context‐dependent manner, my current efforts are being directed towards generating cell lines expressing inducible NUAK1/2 shRNAs. Independent clones have been selected and validated for their knockdown efficiencies and effects on YAP/TAZ downstream target gene expression. Once validated, the selected lines will be subjected to genome‐wide CRISPR screens. We hypothesize that the screens will identify components that enhance or attenuate the effect of NUAKs and will reveal any differential regulators and partners for NUAK1/2. Discovering novel cancer‐relevant NUAK regulators will enhance our understanding of the tumor promoting roles of NUAKs and provide insights into how to target these kinases for better therapeutic outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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