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Enregistrement W4225384189 · doi:10.1038/s42003-022-03379-9

Mapping transgene insertion sites reveals the α-Cre transgene expression in both developing retina and olfactory neurons

2022· article· en· W4225384189 sur OpenAlexafffund
Yimeng Fan, Wenyue Chen, Ran Wei, Qiang Wei, Joel D. Pearson, Tao Yu, Rod Bremner, Danian Chen

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueOlfactory and Sensory Function Studies
Établissements canadiensSinai Health SystemLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésTransgeneBiologyPAX6Olfactory marker proteinGenetically modified mouseOlfactory systemLocus (genetics)Olfactory receptorRetinalRetinaGeneticsGeneMolecular biologyCell biologyNeuroscienceTranscription factor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The Tg(Pax6-cre,GFP) 2Pgr ( α-Cre ) mouse is a commonly used Cre line thought to be retinal-specific. Using targeted locus amplification (TLA), we mapped the insertion site of the transgene, and defined primers useful to deduce zygosity. Further analyses revealed four tandem copies of the transgene. The insertion site mapped to clusters of vomeronasal and olfactory receptor genes. Using R26R and Ai14 Cre reporter mice, we confirmed retinal Cre activity, but also detected expression in Gα 0 + olfactory neurons. Most α-Cre + olfactory neurons do not express Pax6, implicating the influence of neighboring regulatory elements. RT-PCR and buried food pellet test did not detect any effects of the transgene on flanking genes in the nasal mucosa and retina. Together, these data precisely map α-Cre , show that it does not affect surrounding loci, but reveal previously unanticipated transgene expression in olfactory neurons. The α-Cre mouse can be a valuable tool in both retinal and olfactory research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,872
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,308
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,012 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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