Characterization of Protein Tyrosine Phosphatase 1B activator peptides in cells
Notice bibliographique
Résumé
The Protein Tyrosine Phosphatase (PTP) family of phosphatases regulates cell signaling through dephosphorylation of serine, threonine and tyrosine residues of downstream effector proteins. The role of PTPs is very well known in normal cell functions, as well as in disease states such as diabetes and cardiovascular diseases. We previously reported on the role of the phosphotyrosine recognition loop (PTBL) of PTP1B in protein‐protein interactions (Londhe et al. 2020, Nat. Chem. Biol., 16(2):122‐125) and showed that interfering with protein‐protein interactions between PTP1B and 14‐3‐3zusing R18, a pan‐14‐3‐3 inhibitor, destabilizes the reversibly oxidized form of PTP1B (PTP1B‐OX) and activates the phosphatase. We rationally designed peptides using phosphotyrosine recognition loop of PTP1B to determine whether selective and effective activation of PTPs was possible. We first performed a structural analysis to compare the changes occurring in PTP1B‐OX compared to its reduced form. Using this approach, we observed profound conformational changes in the phosphotyrosine recognition loop (PTBL) of PTP1B and rationally designed peptides comprised of the sequence of amino acids of the newly exposed loop, with a TAT (transactivator of transcription) peptide sequence in amino or carboxy‐terminal to facilitate cell permeability. Targeting the PTP1B‐OX‐14‐3‐3z interaction using R18 and TAT‐PTBL peptide led to disruption in protein‐protein interaction and maintained PTP1B in its active form. Interestingly, destabilizing the PTP1B‐OX form by treating cells with rationally designed PTP1B activator peptides also decreased EGFR phosphorylation at PTP1B sites. In cells stimulated with exogenousH 2 O 2 to bypass the NOX‐mediated PTP1B oxidation, the pretreatment with R18 and TAT‐PTBL prevented the interaction between PTP1B‐OX and 14‐3‐3z. Then we observed that our TAT‐PTBL peptide was not interfering with NOX‐mediated reactive oxygen species (ROS) generation, whereas R18, a pan‐14‐3‐3 inhibitor, decreased ROS production significantly. Finally, exposing A431 epidermoid carcinoma cells to PTP1B activator peptides prevented EGFR phosphorylation and impaired colony formation. Collectively our data suggest that the biological activity of PTP1B activator peptides is likely to be therapeutically useful, and could translate into drug leads.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».