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Enregistrement W4225400799 · doi:10.1096/fasebj.2022.36.s1.r6284

A Workflow for Digitizing Anatomical Specimens by Combining Photogrammetry and 3D Scanning

2022· article· en· W4225400799 sur OpenAlexaff
Ishan Dixit, Connor Dunne, Curtis J. Logan, Monika Fejtek, Paige Blumer, Ratthamnoon Prakitpong, Claudia Krebs

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAnatomy and Medical Technology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhotogrammetryLaser scanningComputer graphics (images)Polygon (computer graphics)Texture mappingComputer visionPolygon meshComputer scienceVisualizationArtificial intelligence3d scanningScannerLaserOpticsFrame (networking)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The 3D visualization of anatomical specimens relies on two main technologies: 3D laser surface scanning and photogrammetry (PGM). While 3D laser scanning provides the most accurate 3D model, photogrammetry provides the best, photorealistic surface texture. Typically, a specimen would be assessed to see which technology is best to capture it ‐ in this study we set out to investigate whether it is feasible to combine both methods, incorporating the advantages of both. Artec Space Spider scanner was used to capture accurate geometry of specimens and create a mesh with high polygon count and topological accuracy in Artec Studio 15, and Reality Capture was used to capture photographs around the specimen at regular 5 degree increments until the entire surface was captured to produce a high‐resolution textured mesh. The meshes were combined in Artec Studio 15 by matching their geometric centers in 3D space and ensuring that all polygons are precisely overlapped ‐ even a minor amount of deviation would result in blurry reprojection of texture. This is followed by mapping and reprojecting the PGM texture on the 3D scanned mesh (now aligned and scaled) in Reality Capture and cleaning up the produced texture map in Adobe Photoshop to ensure that any artifacts are cleaned up. Through this combination, models that gather ‘best of both worlds’ qualities from 3D scanning and photogrammetry ‐ laser accurate geometry and photorealism. We determined that 3D scanning is sufficient for specimens with simple texture, and photogrammetry is effective for specimens with complex texture and simple geometry; the combination method shines where great detail and high resolution texture is required to meet the learning objectives, such as organs and musculoskeletal specimens and other specimens with key topological details and colorations. Gathering both PGM and 3D scanning data allows for error correction, especially when performed in collaboration with a content expert and a 3D artist. Availability of these methods to produce photorealistic and accurate scans of specimens lends to accessibility of high quality online anatomy educational materials for students. This technology may also be useful in museum settings and to scan rare collections where to date a single method was not able to capture the complexity of the specimens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,920
Score d'incertitude au seuil0,367

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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