MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4225402521 · doi:10.1096/fasebj.2022.36.s1.r5351

Role of HSP90 Family Molecular Chaperone in Regulating Chloroplast Protein Homeostasis and Plant Development in Arabidopsis

2022· article· en· W4225402521 sur OpenAlexafffund
Rongmin Zhao, Bona Mu, Tim Jiang, Wei‐Tse Tseng, Adheip Monikantan Nair

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésThylakoidChloroplastBiologyTwin-arginine translocation pathwayArabidopsisChaperone (clinical)Cell biologyTransport proteinPlastidBiochemistryCytochrome b6f complexProtein subunitGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chloroplasts carry out photosynthesis in plants and provide most food sources for living organisms. Either divided or differentiated from proplastids and etioplasts, the biogenesis of thylakoid membranes is the hallmark of chloroplast maturation and functionality, and this process requires a large set of photosynthetic proteins that must be synthesized on cytosolic ribosomes and then imported into the chloroplast stroma. Thylakoid lumen proteins travel further through the stroma and then cross the thylakoid membrane through one of the ancestral translocases. Like the cytosolic environment and the other major organelles, a cohort of molecular chaperones and proteases reside within the chloroplast to ensure proper protein homeostasis. We have identified and confirmed the interaction between the essential plastid HSP90 family heat shock protein HSP90C and a thylakoid lumen located photosystem II subunit PsbO1. To understand the biological significance of the interaction, we adopted transgenic approaches, specific HSP90 inhibitors, biochemical and in organello protein transport assays to study how the HSP90 family protein facilitates the representative lumen proteins transport across the thylakoid membrane. Specifically, we showed that the expression of the molecular chaperone is developmentally regulated, and its expression is highly correlated with some photosynthetic proteins while not with the others. Additionally, we demonstrated that HSP90C physically interacts with the thylakoid SEC translocon subunit, and that its chaperone activity is required for efficient PsbO1 transport. We also investigated the signature sequences of different HSP90 subfamily proteins and provided evidence that the chloroplast located HSP90C contains features specialized for some photosynthetic proteins interaction, and thus the chloroplast maturation and functionality.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetPhotosynthetic Processes and Mechanisms→Travaux en français237 207→