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Enregistrement W4225405809 · doi:10.1096/fasebj.2022.36.s1.r4713

Specificity of Antibodies for the Identification of Annexin 1 (ANXA1) Protein in Various Types of Cancer

2022· article· en· W4225405809 sur OpenAlexaff
Karyn Olascuaga‐Castillo, Susana Rubio‐Guevara, Elena Cáceres‐Andonaire, Dan Altamirano‐Sarmiento, Elena Mantilla‐Rodríguez, Julio Hilario‐Vargas, José Andrés Morgado‐Díaz, Maxim V. Berezovski

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueS100 Proteins and Annexins
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesUniversidad Nacional de Trujillo
Mots-clésStainingAntibodyPathologyCancerBiologyAnnexin A1Molecular biologyMedicineAnnexinInternal medicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Annexins are a well‐characterized multigene family of phospholipid‐binding and membrane‐bound proteins that are Ca2+‐regulated. ANXA1 expression is variable in tumor cells, ranging from high levels to none, which is why it is helpful to know the staining potential of various antibodies against the protein. Our research aims to evaluate the specificity of five antibodies used to detect ANXA1 expression in selecting different types of cancer and normal tissue and the differential specificity between the two groups. We examined a data set composed of 2177 samples from The Human Protein Atlas (HPA) as mentioned, cancer patients:1904 samples, and healthy persons: 273 samples. We examined the specificity of five different antibody types of detecting ANXA1 expression (HPA011271, HPA011272, CAB013023, CAB035987, and CAB058693). The specificity of each antibody against ANXA1 protein was evaluated using a staining scale of 0 ‐ 3.00, where 0 indicates no staining, 0.01‐1.0 low staining, 1.01 ‐ 2.0 medium staining, and 2.01 ‐ 3.00 high staining. Results CAB013023 had the highest staining values for both cancer and healthy samples; thyroid cancer and endometrial cancer had the highest staining values (2.75 and 2.80, respectively). Breast, head and neck, and bladder normal tissues stained the most intensely in healthy samples (3.00 in all three cases). The antibody's specificity for identifying ANXA1 expression suggests that this may be used as a prognosis and treatment marker in cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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