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Enregistrement W4225419539 · doi:10.1096/fasebj.2022.36.s1.r4778

Subcellular Protein Expression of Annexin A1 (ANXA1) in Different Types of Cancer

2022· article· en· W4225419539 sur OpenAlexaff
Karyn Olascuaga‐Castillo, Susana Rubio‐Guevara, Elena Cáceres‐Andonaire, Olga E. Caballero-Aquiño, Elena Mantilla‐Rodríguez, Julio Hilario‐Vargas, José Andrés Morgado‐Díaz, Maxim V. Berezovski

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueS100 Proteins and Annexins
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesUniversidad Nacional de Trujillo
Mots-clésSubcellular localizationCytoplasmAnnexin A1StainingNuclear localization sequenceBiologyCancerPathologyCell biologyAnnexinMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Annexin A1 (ANXA1) is a Ca2+‐regulated phospholipid‐binding protein involved in several physiological functions. Further research has shown that this protein might have various roles in cancer development and operate at different levels. This is partially related to the placement of ANXA1 in distinct cellular compartments. ANXA1 is maybe nuclear, cytoplasmic, and membrane‐associated. The goal of this study has been to analyze ANXA1 subcellular localization and expression in different types of cancer. Methods We examined 1295 data sets available in The Human Protein Atlas (HPA) (HPA). The research examined the ANXA1 expression in tissue from 1130 cancer and 165 normal samples. A visual categorization method based on staining intensity (I), the proportion of stained cells (F) (F). ANXA1 expression levels as a function of subcellular localization. Q Score (product of E*I) was calculated by the fraction of stained cells (F) and the intensity (I) (I) Results In cancer patients, the predominant subcellular localization was cytoplasmic membranous (53.3 %), whereas, in healthy individuals, the principal was cytoplasmic membranous and nuclear (57.0 %). In terms of staining intensity (Q Score), the highest values were found at the cytoplasmic membranous and nuclear levels (Q Score=5.69). In contrast, the highest Q Score values were found in standard samples at the nuclear level (Q Score=6.0). Conclusion The subcellular localization of ANXA1 expression may be a helpful diagnostic marker in various cancer types.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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