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Enregistrement W4225605120 · doi:10.3389/fmicb.2022.833655

Genetic Screening of Candida albicans Inactivation Mutants Identifies New Genes Involved in Macrophage-Fungal Cell Interactions

2022· article· en· W4225605120 sur OpenAlexafffund
Pablo Godoy, Peter J. Darlington, Malcolm Whiteway

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensUniversité de MontréalConcordia University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchConcordia University
Mots-clésCandida albicansMutantGeneBiologyMacrophageMicrobiologyGenetic screenCellFungal proteinGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Candida albicans, an important fungal pathogen of humans, displays different morphologies, such as yeast, pseudo-hyphae and hyphae, which are recognized unequally by phagocytic cells of the innate immune response. Once C. albicans cells invade host tissues, immune cells such as macrophages are attracted to the site of infection and activated to recognize, engulf and kill the pathogen. We have investigated this fungal cell-macrophage interface by using high-throughput screening of the C. albicans GRACE library to identify genes that can influence this interaction and modify the kinetics of engulfment. Compared with the wild-type (WT) strain, we identified generally faster rates of engulfment for those fungal strains with constitutive pseudo-hyphal and hyphal phenotypes, whereas yeast-form-locked strains showed a reduced and delayed recognition and internalization by macrophages. We identified a number of GRACE strains that showed normal morphological development but exhibited different recognition and engulfment kinetics by cultured macrophages and characterized two mutants that modified interactions with the murine and human-derived macrophages. One mutant inactivated an uncharacterized C. albicans open reading frame that is the ortholog of S. cerevisiae OPY1, the other inactivated CaKRE1. The modified interaction was monitored during a 4 h co-culture. Early in the interaction, both opy1 and kre1 mutant strains showed reduced recognition and engulfment rates by macrophages when compared with WT cells. At fungal germ tube initiation, the engulfment kinetics increased for both mutants and WT cells, however the WT cells still showed a higher internalization by macrophages up to 2 h of interaction. Subsequently, between 2 and 4 h of the interaction, when most macrophages contain engulfed fungal cells, the engulfment kinetics increased for the opy1 mutant and further decreased for the kre1 mutant compared with Ca-WT. It appears that fungal morphology influences macrophage association with C. albicans cells and that both OPY1 and KRE1 play roles in the interaction of the fungal cells with phagocytes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2022
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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