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Enregistrement W4226145696 · doi:10.1038/s41525-022-00299-9

Genetic evidence supports the development of SLC26A9 targeting therapies for the treatment of lung disease

2022· article· en· W4226145696 sur OpenAlex
Jiafen Gong, Gengming He, Cheng Wang, Claire Bartlett, Naim Panjwani, Scott Mastromatteo, Lin Fan, Katherine Keenan, Julie Avolio, Anat Halevy, Michelle Shaw, Mohsen Esmaeili, Guillaume Côté-Maurais, Damien Adam, Stéphanie Bégin, Candice Bjornson, Mark Chilvers, Joe Reisman, April Price, Michael D. Parkins, Richard van Wylick, Yves Berthiaume, Lara Bilodeau, Dimas Mateos‐Corral, Daniel Hughes, Mary Jane Smith, Nancy Morrison, Janna Brusky, Elizabeth Tullis, Anne L. Stephenson, Bradley S. Quon, Pearce Wilcox, Winnie M. Leung, Melinda Solomon, Lei Sun, Emmanuelle Brochiero, Theo J. Moraes, Tanja Gonska, Félix Ratjen, Johanna M. Rommens, Lisa J. Strug

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

Revuenpj Genomic Medicine · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensUniversity of Alberta HospitalAlberta Hospital EdmontonSt. Michael's HospitalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecMemorial University of NewfoundlandFoothills Medical CentreLondon Health Sciences CentreSt. Paul's HospitalIzaak Walton Killam Health CentreAlberta Children's HospitalUniversity of SaskatchewanHospital for Sick ChildrenUniversité de MontréalQueen Elizabeth II Health Sciences CentreChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversité LavalBC Children's HospitalCentre Hospitalier de l’Université de MontréalKingston Health Sciences CentrePublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesHospital for Sick ChildrenNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCystic Fibrosis CanadaGovernment of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaGovernment of OntarioMedical Research CouncilCystic Fibrosis Foundation TherapeuticsCystic Fibrosis Foundation
Mots-clésMedicineCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorCystic fibrosisCOPDPopulationSpirometryInternal medicineBiobankLungPharmacologyBioinformaticsOncologyBiologyEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Over 400 variants in the cystic fibrosis (CF) transmembrane conductance regulator ( CFTR ) are CF-causing. CFTR modulators target variants to improve lung function, but marked variability in response exists and current therapies do not address all CF-causing variants highlighting unmet needs. Alternative epithelial ion channel/transporters such as SLC26A9 could compensate for CFTR dysfunction, providing therapeutic targets that may benefit all individuals with CF. We investigate the relationship between rs7512462, a marker of SLC26A9 activity, and lung function pre- and post-treatment with CFTR modulators in Canadian and US CF cohorts, in the general population, and in those with chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Rs7512462 CC genotype is associated with greater lung function in CF individuals with minimal function variants (for which there are currently no approved therapies; p = 0.008); and for gating ( p = 0.033) and p.Phe508del/ p.Phe508del ( p = 0.006) genotypes upon treatment with CFTR modulators. In parallel, human nasal epithelia with CC and p.Phe508del/p.Phe508del after Ussing chamber analysis of a combination of approved and experimental modulator treatments show greater CFTR function ( p = 0.0022). Beyond CF, rs7512462 is associated with peak expiratory flow in a meta-analysis of the UK Biobank and Spirometa Consortium ( p = 2.74 × 10 −44 ) and provides p = 0.0891 in an analysis of COPD case-control status in the UK Biobank defined by spirometry. These findings support SLC26A9 as a therapeutic target to improve lung function for all people with CF and in individuals with other obstructive lung diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,522
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle