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Enregistrement W4226146833 · doi:10.1101/2022.04.05.22273469

Human Papillomavirus Infection Rate by Genotype and Vaccination Rates in Canada: Canadian Health Measures Survey 2009 to 2013

2022· preprint· en· W4226146833 sur OpenAlexaboutno aff
Yi‐Sheng Chao

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenital wartsVaccinationMedicineGenotypeDemographyHPV infectionHuman papillomavirusHPV vaccinesCervical cancerInternal medicineBiologyCancerVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background An infection with certain HPV genotypes can lead to cancer or genital warts. HPV can be detected with PCR-based tests, and some genotypes can be prevented by vaccines. However, since the infection rates of various HPV genotypes have not been well reported, the present study aims to provide this information. Methods The Canadian Health Measures Survey (CHMS) is an ongoing biannual national survey. Between 2009 and 2011, it sampled a nationally representative sample of females aged 14 to 59 years to determine the infection rates of 46 HPV genotypes. Females aged 9 to 29 years and 9 to 59 years were asked whether they received HPV vaccines between 2009 to 2011 (cycle 2) and 2012 to 2013 (cycle 3), respectively. The reported infection rates and vaccination proportions were weighted and adjusted for the survey design. Results Among the estimated 10,592,968 females aged 14 to 59 years at cycle 2, the HPV genotypes with the highest infection rates were 16, 62, 74, and 54, and the rates were 3.42% (95% CI = 1.67% to 5.17%), 2.14% (95% CI = 0.68% to 3.59%), 2.1% (95% CI = 0.51% to 3.69%), and 2.04% (95% CI = 0.38% to 3.7%), respectively. There were an estimated 6,569,100 and 11,603,752 females aged 9 to 29 and 9 to 59 years at cycles 2 and 3, respectively. The proportions receiving a HPV vaccine were 13.55% (11.18% to 15.92%) and 12.3% (9.8% to 14.79%), respectively. The estimated numbers of females that received HPV vaccines were 890,197 and 1,427,000, respectively. Conclusion Canada is one of the few countries that conduct national surveys to determine HPV infection rates by genotype, which are not limited to the surveillance of carcinogenic genotypes. Our study found discrepancies between the HPV genotypes whose infections were the most common, that could be detected by PCR tests, that were carcinogenic, and that could be prevented by vaccines. For example, 5 of the 7 genotypes (42, 54, 62, 66, and 74) with infection rates of more than 1% cannot be detected by PCR tests and are not targeted by vaccines. HPV 51 is carcinogenic, associated with genital warts, and can be detected by PCR tests, but it is not targeted by vaccines. We recommend a better alignment of the genotypes targeted by HPV tests and vaccines with those genotypes with the highest infection rates in Canada.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,304

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,008
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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