Early branching arbuscular mycorrhizal fungus Paraglomus occultum carries a small and repeat-poor genome compared to relatives in the Glomeromycotina
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The arbuscular mycorrhizal fungi (AMFs) are obligate root symbionts in the subphylum Glomeromycotina that can benefit land plants by increasing their soil nutrient uptake in exchange for photosynthetically fixed carbon sources. To date, annotated genome data from representatives of the AMF orders Glomerales, Diversisporales and Archaeosporales have shown that these organisms have large and highly repeated genomes, and no genes to produce sugars and fatty acids. This led to the hypothesis that the most recent common ancestor (MRCA) of Glomeromycotina was fully dependent on plants for nutrition. Here, we aimed to further test this hypothesis by obtaining annotated genome data from a member of the early diverging order Paraglomerales ( Paraglomus occultum ). Genome analyses showed this species carries a 39.6 Mb genome and considerably fewer genes and repeats compared to most AMF relatives with annotated genomes. Consistent with phylogenies based on ribosomal genes, our phylogenetic analyses suggest P. occultum as the earliest diverged branch within Glomeromycotina. Overall, our analyses support the view that the MRCA of Glomeromycotina carried hallmarks of obligate plant biotrophy. The small genome size and content of P. occultum could either reflect adaptive reductive processes affecting some early AMF lineages, or indicate that the high gene and repeat family diversity thought to drive AMF adaptability to host and environmental change was not an ancestral feature of these prominent plant symbionts.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle