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Enregistrement W4229010457 · doi:10.1038/s41588-022-01057-4

Genetic architecture of 11 major psychiatric disorders at biobehavioral, functional genomic and molecular genetic levels of analysis

2022· article· en· W4229010457 sur OpenAlexaff
Andrew D. Grotzinger, Travis T. Mallard, Wonuola A. Akingbuwa, Hill F. Ip, Mark J. Adams, Cathryn M. Lewis, Andrew M. McIntosh, Jakob Grove, Søren Dalsgaard, Klaus‐Peter Lesch, Nora I. Strom, Sandra Meier, Manuel Mattheisen, Anders D. Børglum, Ole Mors, Gerome Breen, Phil H. Lee, Kenneth S. Kendler, Jordan W. Smoller, Elliot M. Tucker–Drob, Michel G. Nivard

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthNational Institute on AgingMedical Research CouncilH. Lundbeck A/SHorizon 2020 Framework ProgrammeNovo Nordisk FondenLundbeckfondenJacobs FoundationZonMwEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentAarhus UniversitetEuropean CommissionNovo NordiskNational Institute for Health and Care ResearchNational Institutes of HealthNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekWellcome TrustFritz Thyssen StiftungSouth London and Maudsley NHS Foundation TrustDeutsche ForschungsgemeinschaftKing's College LondonUK Research and Innovation
Mots-clésGenetic architectureBiologyGeneticsGenome-wide association studyGenetic associationPsychiatric geneticsGeneSchizophrenia (object-oriented programming)PsychologyPsychiatrySingle-nucleotide polymorphismPhenotypeGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We interrogate the joint genetic architecture of 11 major psychiatric disorders at biobehavioral, functional genomic and molecular genetic levels of analysis. We identify four broad factors (neurodevelopmental, compulsive, psychotic and internalizing) that underlie genetic correlations among the disorders and test whether these factors adequately explain their genetic correlations with biobehavioral traits. We introduce stratified genomic structural equation modeling, which we use to identify gene sets that disproportionately contribute to genetic risk sharing. This includes protein-truncating variant-intolerant genes expressed in excitatory and GABAergic brain cells that are enriched for genetic overlap across disorders with psychotic features. Multivariate association analyses detect 152 (20 new) independent loci that act on the individual factors and identify nine loci that act heterogeneously across disorders within a factor. Despite moderate-to-high genetic correlations across all 11 disorders, we find little utility of a single dimension of genetic risk across psychiatric disorders either at the level of biobehavioral correlates or at the level of individual variants. Joint analysis of 11 major psychiatric disorders identifies four broad factor underlying genetic correlations among the disorders. Association analyses detect 152 loci acting on these factors and identify 9 loci that act heterogeneously across disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,202
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations323
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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