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Enregistrement W4229026512 · doi:10.21203/rs.3.rs-1619662/v1

Metabolomic Profiling of Equine Cord Blood Mesenchymal Stromal Cells in Both Early and Late Stages of Culture

2022· preprint· en· W4229026512 sur OpenAlexaff
Saba Oji, Cara Ruth Pilgrim, Thomas G. Koch, Pavneesh Madan

Notice bibliographique

RevueResearch Square · 2022
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMesenchymal stem cell research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMesenchymal stem cellCord bloodMetabolomicsFetal bovine serumStromal cellBiologyMetabolismUmbilical cordCellular metabolismCell biologyAndrologyBioinformaticsCellImmunologyMedicineEndocrinologyBiochemistryCancer research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction: Equine Mesenchymal Stromal Cells (MSC) hold great potential as a future form of cellular therapy. Fetal Bovine Serum (FBS) is used as a supplement MSC culture, but challenges with its use have initiated a desire to create a defined media to expand these cells. MSCs have shown great variability in species, tissue source and passage number. Due to this, to effectively create a replacement for FBS we must better understand how it meets the metabolic needs for each type of MSC. Objectives: The goal of this study is to determine key pathways and differences in pathways between the early and late passages of equine cord blood MSCs. Methods: This study utilized metabolomics to give a snapshot of the metabolism in the long-term culture of equine cord blood MSCs (eCB-MSC) by comparing the profile of plain culture media to spend media. Results: We found two significantly different metabolites between the early and late passage of eCB-MSC, alpha-ketoglutaric acid (p = 0.019) and creatine (p = 0.012). As well, the metabolic results allowed us to perform an enrichment analysis to assess which pathway(s) were most relevant. Conclusion: The two metabolites suggest a difference in metabolism between the early and late passage reflecting different cellular priorities. Insights into the unique metabolism of these cells and how the requirement of the cell differs between the early and late passage may allow the formulation a serum free media tailored to the metabolic needs of eCB-MSC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,408
Écart entre enseignants0,336 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
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Résumé présentoui

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