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Enregistrement W4229032942 · doi:10.3389/fbioe.2022.871933

FAS2FURIOUS: Moderate-Throughput Secreted Expression of Difficult Recombinant Proteins in Drosophila S2 Cells

2022· article· en· W4229032942 sur OpenAlexfundno aff
Jesse A. Coker, V.L. Katis, M. Fairhead, Anja Schwenzer, Stine B. Clemmensen, Bent U. Frandsen, Willem A. de Jongh, O. Gileadi, N. Burgess-Brown, Brian D. Marsden, Kim S. Midwood, Wyatt W. Yue

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Bioengineering and Biotechnology · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueViral Infectious Diseases and Gene Expression in Insects
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistero dello Sviluppo EconomicoFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloOntario Ministry of Economic Development and InnovationEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsNovartis PharmaWellcome TrustKennedy Trust for Rheumatology ResearchGenome CanadaUniversity of TokyoPfizer
Mots-clésSf9Schneider 2 cellsBiologyDrosophila melanogasterCell biologyBottleneckRecombinant DNAComputational biologySpodopteraThroughputGlycoproteinCell cultureclone (Java method)GeneGeneticsRNA interferenceComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recombinant protein expression in eukaryotic insect cells is a powerful approach for producing challenging targets. However, due to incompatibility with standard baculoviral platforms and existing low-throughput methodology, the use of the Drosophila melanogaster “S2” cell line lags behind more common insect cell lines such as Sf9 or High-Five™. Due to the advantages of S2 cells, particularly for secreted and secretable proteins, the lack of a simple and parallelizable S2-based platform represents a bottleneck, particularly for biochemical and biophysical laboratories. Therefore, we developed FAS2FURIOUS, a simple and rapid S2 expression pipeline built upon an existing low-throughput commercial platform. FAS2FURIOUS is comparable in effort to simple E. coli systems and allows users to clone and test up to 46 constructs in just 2 weeks. Given the ability of S2 cells to express challenging targets, including receptor ectodomains, secreted glycoproteins, and viral antigens, FAS2FURIOUS represents an attractive orthogonal approach for protein expression in eukaryotic cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,195
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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