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Enregistrement W4229442567 · doi:10.1183/23120541.lsc-2022.123

Regulation of MHC I expression in lung epithelial cells during inflammation.

2022· article· en· W4229442567 sur OpenAlexaff
Justine Mathé, Mohamed Benhammadi, Sylvie Brochu, Claude Perreault

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiquePediatric health and respiratory diseases
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDownregulation and upregulationInflammationAlveolar EpitheliumLungRespiratory epitheliumImmunologyMajor histocompatibility complexBiologyImmune systemCell biologyMHC class ICytokineEpitheliumMHC class IIAntigen presentationBronchoalveolar lavageMedicineT cellGeneInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infections of the respiratory tract are a perennial cause of death worldwide. These diseases typically affect the lung epithelium, composed of three main types of cells: alveolar type I (AT1), alveolar type 2 (AT2), and bronchiolar cells. These three epithelial cells (ECs) types express constitutively low levels of MHC I, representing less than 1% of the levels found in thymic ECs. This weak expression is surprising since it could disturb the elimination of infected or transformed cells. We hypothesized that lung ECs should be able to upregulate their MHC I expression swiftly when needed. We induced lung inflammation in mice using inhalation of LPS. We observed that AT1, AT2, and bronchiolar cells upregulated by 25 times their surface expression of MHC I during LPS-induced inflammation. The concerted production of the three IFN families, thanks to the factors Stat1, Stat2, and Nlrc5, drove this upregulation. The low expression of genes involved in the peptide loading of MHC I molecules nevertheless hampered MHC I upregulation in lung ECs. Discrete gene subsets were selectively differentially regulated by interferon signaling in each type of lung ECs. AT1 increased genes related to cytokine-mediated signaling pathway while AT2 and bronchiolar decreased genes involved in their specialized functions, essential to maintaining the integrity of lung epithelium (epithelium regeneration and cilium movement, respectively). Our results showed a balance between the expression of transcripts involved in immune defenses and transcripts maintaining lung epithelium integrity in lung ECs. It paves the way to a better understanding of antigen presentation in lung ECs, and the pathogenesis of lung inflammation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,326 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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