Regulation of MHC I expression in lung epithelial cells during inflammation.
Notice bibliographique
Résumé
Infections of the respiratory tract are a perennial cause of death worldwide. These diseases typically affect the lung epithelium, composed of three main types of cells: alveolar type I (AT1), alveolar type 2 (AT2), and bronchiolar cells. These three epithelial cells (ECs) types express constitutively low levels of MHC I, representing less than 1% of the levels found in thymic ECs. This weak expression is surprising since it could disturb the elimination of infected or transformed cells. We hypothesized that lung ECs should be able to upregulate their MHC I expression swiftly when needed. We induced lung inflammation in mice using inhalation of LPS. We observed that AT1, AT2, and bronchiolar cells upregulated by 25 times their surface expression of MHC I during LPS-induced inflammation. The concerted production of the three IFN families, thanks to the factors Stat1, Stat2, and Nlrc5, drove this upregulation. The low expression of genes involved in the peptide loading of MHC I molecules nevertheless hampered MHC I upregulation in lung ECs. Discrete gene subsets were selectively differentially regulated by interferon signaling in each type of lung ECs. AT1 increased genes related to cytokine-mediated signaling pathway while AT2 and bronchiolar decreased genes involved in their specialized functions, essential to maintaining the integrity of lung epithelium (epithelium regeneration and cilium movement, respectively). Our results showed a balance between the expression of transcripts involved in immune defenses and transcripts maintaining lung epithelium integrity in lung ECs. It paves the way to a better understanding of antigen presentation in lung ECs, and the pathogenesis of lung inflammation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».